The Semanticscience Integrated Ontology (SIO) for biomedical research and knowledge discovery.
The Semanticscience Integrated Ontology (SIO) for biomedical research and knowledge discovery.
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DOI：
10.1186/2041-1480-5-14
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发表时间：
2014-03-06
影响因子：
1.9
通讯作者：
Hoehndorf R
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Dumontier M;Baker CJ;Baran J;Callahan A;Chepelev L;Cruz-Toledo J;Del Rio NR;Duck G;Furlong LI;Keath N;Klassen D;McCusker JP;Queralt-Rosinach N;Samwald M;Villanueva-Rosales N;Wilkinson MD;Hoehndorf R
语义科学集成本体（SIO）是一种促进生物医学知识发现的本体。SIO具有由基本类型和关系组成的简单上层，用于丰富描述任意（真实的、假设的、虚拟的、虚构的）对象、过程及其属性。SIO指定了简单的设计模式来描述和关联质量、能力、功能、数量和信息实体，包括文本、几何和数学实体，并在化学、生物学、生物化学和生物信息学领域提供了特定的扩展。SIO为生命科学项目的Bio 2 RDF链接数据提供了本体论基础，并用于基于SADI的语义Web服务的语义集成和发现。SIO是根据署名许可的创作共用向所有用户免费提供的。更多信息请参见网站：http://sio.semanticscience.org。本文的在线版本（doi：10.1186/2041-1480-5-14）包含补充材料，可供授权用户使用。
The Semanticscience Integrated Ontology (SIO) is an ontology to facilitate biomedical knowledge discovery. SIO features a simple upper level comprised of essential types and relations for the rich description of arbitrary (real, hypothesized, virtual, fictional) objects, processes and their attributes. SIO specifies simple design patterns to describe and associate qualities, capabilities, functions, quantities, and informational entities including textual, geometrical, and mathematical entities, and provides specific extensions in the domains of chemistry, biology, biochemistry, and bioinformatics. SIO provides an ontological foundation for the Bio2RDF linked data for the life sciences project and is used for semantic integration and discovery for SADI-based semantic web services. SIO is freely available to all users under a creative commons by attribution license. See website for further information: http://sio.semanticscience.org. The online version of this article (doi:10.1186/2041-1480-5-14) contains supplementary material, which is available to authorized users.
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