Approximations to profile score distributions.
Approximations to profile score distributions.
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DOI：
10.1089/cmb.1994.1.93
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发表时间：
1994-01-01
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
Waterman, M S
中科院分区：
文献类型：
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作者：
Goldstein, L;Waterman, M S
Profile是一个序列家族的多个比对的汇总，用于在数据库中查找该家族的新实例。在这篇文章中，我们研究了当轮廓在随机序列的所有可能位置上无指数对齐时所获得的最大分数M。主要定理给出了M的分布函数的一个近似，并给出了误差的一个显式界。这个定理意味着M有一个极限极值分布。
Profiles, which are summaries of multiple alignments of a sequence family, are used to find new instances of the family in databases. In this paper, we study the maximum score M obtained when the profile is aligned without indels at all possible positions of a random sequence. The main theorem gives an approximation to the distribution function of M with an explicit bound on the error. This theorem implies that M has a limiting extreme value distribution.