Packaged and Free Satellite Tobacco Mosaic Virus (STMV) RNA Genomes Adopt Distinct Conformational States.
Packaged and Free Satellite Tobacco Mosaic Virus (STMV) RNA Genomes Adopt Distinct Conformational States.
复制标题
DOI：
10.1021/acs.biochem.6b01166
复制
发表时间：
2017-04-25
期刊：
影响因子：
2.9
通讯作者：
Weeks KM
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Larman BC;Dethoff EA;Weeks KM
病毒的RNA基因组在其复制周期中可能经历多个功能上重要的构象变化，这些变化目前知之甚少。我们使用了两种互补的溶液中RNA结构探测策略（SHAPE-MaP和RING-MaP）来检查真实病毒体内部和无衣壳状态下卫星烟草花叶病毒RNA基因组的结构。两种RNA状态都具有相似的三结构域结构，其中每个主要复制功能（翻译、衣壳编码和基因组合成）都属于不同的结构域。然而，有很大的构象之间的差异，在病毒体和captlant的自由状态，主要是在一个手臂的中央T结构域。这些数据支持一个模型，其中包装的衣壳结合的RNA被约束在本地的高能量构象的天然衣壳壳。病毒衣壳的去除然后允许RNA基因组松弛成更稳定的构象。这些数据支持一个模型，其中中央T结构域的RNA结构在衣壳组装和拆卸过程中发生变化，并可能在基因组包装中发挥作用。
The RNA genomes of viruses likely undergo multiple functionally important conformational changes during their replication cycles, changes that are poorly understood at present. We used two complementary in-solution RNA structure probing strategies (SHAPE-MaP and RING-MaP) to examine the structure of the RNA genome of satellite tobacco mosaic virus inside authentic virions and in a capsid-free state. Both RNA states feature similar three-domain architectures in which each major replicative function – translation, capsid coding, and genome synthesis – fall into distinct domains. There are, however, large conformational differences between the in-virion and capsid-free states, primarily in one arm of the central T domain. These data support a model in which the packaged capsid-bound RNA is constrained in a local high-energy conformation by the native capsid shell. The removal of the viral capsid then allows the RNA genome to relax into a more thermodynamically stable conformation. These data support a model in which the RNA architecture of the central T domain changes during capsid assembly and disassembly and may play a role in genome packaging.
登录
查看更多内容
DOI：
10.1261/rna.043323.113
发表时间：
2014-06
期刊：
RNA (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Rice GM;Leonard CW;Weeks KM
通讯作者：
Weeks KM
DOI：
10.1073/pnas.1219988110
发表时间：
2013-04-02
影响因子：
11.1
作者：
Hajdin, Christine E.;Bellaousov, Stanislav;Weeks, Kevin M.
通讯作者：
Weeks, Kevin M.
影响因子：
2.9
作者：
Schroeder, Susan J.
通讯作者：
Schroeder, Susan J.
影响因子：
5.6
作者：
Larson, SB;Day, J;McPherson, A
通讯作者：
McPherson, A
影响因子：
3.7
作者：
MIRKOV, TE;MATHEWS, DM;DODDS, JA
通讯作者：
DODDS, JA