HLA class I and II genotype of the NCI-60 cell lines.
HLA class I and II genotype of the NCI-60 cell lines.
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DOI：
10.1186/1479-5876-3-11
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发表时间：
2005-03-04
影响因子：
7.4
通讯作者：
Marincola FM
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Adams S;Robbins FM;Chen D;Wagage D;Holbeck SL;Morse HC 3rd;Stroncek D;Marincola FM
自90年代初以来，六十种癌细胞系已被国家癌症研究所的发育治疗计划（NCI-60）广泛表征并用作抗癌药物开发的筛选工具。已经积累了一个广泛的数据库，可以用来选择个别细胞系的特定实验设计的基础上，他们的全球遗传和生物学概况。然而，这些细胞系的人类白细胞抗原（HLA）基因型的信息是很少的，大多是过时的，因为它是来自血清学分型。因此，我们通过基于高分辨率序列的分型对NCI-60细胞系组进行了重新分型。该信息可用于：1）鉴定和验证不同机构中相同细胞系的身份; 2）检查培养物中可能的污染细胞系; 3）采用单个细胞系用于与HLA分子表达知识相关的实验。由于基于基因组的分型不能保证实际的表面蛋白表达，因此应考虑对相关细胞系进行进一步表征，以在需要正确抗原呈递的实验中验证表面表达。
Sixty cancer cell lines have been extensively characterized and used by the National Cancer Institute's Developmental Therapeutics Program (NCI-60) since the early 90's as screening tools for anti-cancer drug development. An extensive database has been accumulated that could be used to select individual cells lines for specific experimental designs based on their global genetic and biological profile. However, information on the human leukocyte antigen (HLA) genotype of these cell lines is scant and mostly antiquated since it was derived from serological typing. We, therefore, re-typed the NCI-60 panel of cell lines by high-resolution sequence-based typing. This information may be used to: 1) identify and verify the identity of the same cell lines at various institutions; 2) check for possible contaminant cell lines in culture; 3) adopt individual cell lines for experiments in which knowledge of HLA molecule expression is relevant. Since genome-based typing does not guarantee actual surface protein expression, further characterization of relevant cell lines should be entertained to verify surface expression in experiments requiring correct antigen presentation.
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DOI：
10.1093/jnci/83.11.757
发表时间：
1991-06-05
期刊：
JOURNAL OF THE NATIONAL CANCER INSTITUTE
影响因子：
--
作者：
MONKS, A;SCUDIERO, D;BOYD, M
通讯作者：
BOYD, M
影响因子：
4.4
作者：
Fong, WG;Liston, P;Korneluk, RG
通讯作者：
Korneluk, RG
影响因子：
7.4
作者：
Ramon, Daniel;Braden, Megan;Wang, Lu
通讯作者：
Wang, Lu
影响因子：
30.8
作者：
Ross, DT;Scherf, U;Brown, PO
通讯作者：
Brown, PO
影响因子：
30.8
作者：
Scherf, U;Ross, DT;Weinstein, JN
通讯作者：
Weinstein, JN