Formation of the G-quadruplex and i-motif structures in retinoblastoma susceptibility genes (Rb).
Formation of the G-quadruplex and i-motif structures in retinoblastoma susceptibility genes (Rb).
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DOI：
10.1093/nar/gkj485
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发表时间：
2006
影响因子：
14.9
通讯作者：
Sugiyama H
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Xu Y;Sugiyama H
用化学修饰、圆二色性（CD）和荧光光谱法研究了视网膜母细胞瘤（Rb）基因5′端G-四链体和i-基序结构的形成。结果发现，在反平行G-四链体中显示顺式构象的位置处的8-甲基鸟嘌呤的取代稳定了富含G链的结构。互补的富含C的18聚体形成i基序结构，如CD光谱所示。基于C到T突变实验，确定了参与i-基序结构的C-C+碱基对的C碱基。2-氨基嘌呤（2-AP）取代实验表明，相对于双链体，G-四链体中荧光的增加归因于G-四链体环内未堆叠的2-AP。荧光实验表明，G-四链体和i-基序的形成可以与双链体形成竞争。此外，聚合酶阻滞试验表明，在Rb基因中形成的G-四链体结构作为DNA合成的障碍。
The formation of G-quadruplex and i-motif structures in the 5′ end of the retinoblastoma (Rb) gene was examined using chemical modifications, circular dichroism (CD) and fluorescence spectroscopy. It was found that substitutions of 8-methylguanine at positions that show syn conformations in antiparallel G-quadruplexes stabilize the structure in the G-rich strand. The complementary C-rich 18mer forms an i-motif structure, as suggested by CD spectroscopy. Based on the C to T mutation experiments, C bases participated in the C–C+ base pair of the i-motif structure were determined. Experiments of 2-aminopurine (2-AP) substitution reveal that an increase of fluorescence in the G-quadruplex relative to duplex is attributed to unstacked 2-AP within the loop of G-quadruplex. The fluorescence experiments suggest that formation of the G-quadruplex and i-motif can compete with duplex formation. Furthermore, a polymerase arrest assay indicated that formation the G-quadruplex structure in the Rb gene acts as a barrier in DNA synthesis.
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DOI：
10.1038/nsb0294-83
发表时间：
1994-02-01
期刊：
NATURE STRUCTURAL BIOLOGY
影响因子：
--
作者：
AHMED, S;KINTANAR, A;HENDERSON, E
通讯作者：
HENDERSON, E
影响因子：
3
作者：
Postel, EH;Berberich, SJ;Kaetzel, DM
通讯作者：
Kaetzel, DM
影响因子：
15
作者：
Dominick, PK;Jarstfer, MB
通讯作者：
Jarstfer, MB
影响因子：
64.5
作者：
Hackett, JA;Feldser, DM;Greider, CW
通讯作者：
Greider, CW
影响因子：
14.9
作者：
Phan, AT;Mergny, JL
通讯作者：
Mergny, JL