全转录组分析建立食管癌风险预测模型及其评估

全转录组分析建立食管癌风险预测模型及其评估
复制标题

DOI：
10.7507/1007-4848.202102010
复制
发表时间：
2023
期刊：
中国胸心血管外科临床杂志
影响因子：
--
通讯作者：
韩勇
韩勇
中科院分区：
--
文献类型：
--
作者：
冯杨波;熊延路;赵晋波;雷杰;辛少伟;乔天运;周永生;张晓;姜涛;韩勇

文献摘要

相似文献

目的拟通过全转录组分析建立基于基因表达数据的食管癌(esophageal cancer,ESCA)风险预测模型,为改进ESCA治疗策略、提高患者预后提供依据。方法从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库获取食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)和食管腺癌(esophageal adenocarcinoma,EAC)组织及癌旁组织的RNA测序数据和癌组织对应的临床数据。通过edgeR法筛选出ESCA癌组织与正常组织的差异基因,并通过单变量Cox回归分析初步找出影响ESCC和EAC患者生存状态的关键基因。利用最小绝对收缩和选择算子回归分析和多变量Cox回归分析进一步筛选基因,并分别建立ESCC和EAC的风险评分预测模型。结果风险评分是ESCA的独立预后因子,该风险评分与患者生存状态显著相关。在ESCC中,风险评分与T分期相关;在EAC中,风险评分与淋巴结转移、远处转移和临床分期相关。构建的以风险评分为基础的列线图展现出了较好的预测能力。ESCC中,风险评分和肿瘤免疫细胞浸润及免疫检查点基因的表达有关。然而,EAC中该特征并不显著。结论ESCC和EAC的风险评分预测模型显示出了较好的预测能力,其对优化ESCA的管理、改善患者预后提供了启发和依据。