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メタゲノムおよびメタボローム解析を用いた実環境での殺藻細菌の機能解明

メタゲノムおよびメタボローム解析を用いた実環境での殺藻細菌の機能解明
利用宏基因组和代谢组分析阐明真实环境中杀藻细菌的功能
批准号:
20H03070
负责人:
藤田 雅紀
金额:
$11.23万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2020-04-01 至 2025-03-31

项目摘要

项目成果

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①同定した殺藻細菌の活性安定化の検討 殺藻細菌の実環境への利用が期待されるが、継代中に殺藻活性を失うことがあり、その安定性が問題となる。そこで活性維持株を利用した活性喪失株の再活性化を検討した。その結果、活性維持株培養液を濾過滅菌したものは再活性化の機能が無かった。一方、活性維持株と活性喪失株を共存させると、活性が回復する例が認められ、なんらかの相互作用の存在が示された。②赤潮・アオコ発生促進に関与する微生物の存在解析 Pusedomonas属殺藻細菌培養液から緑藻増殖促進物質の探索を行ったところ、植物ホルモンとして知られるindole-3-acetic acid およびその異性体である3-hydroxyacetyl indoleを候補化合物として見出した。それらの標品を用いてアッセイしたところ、いずれの化合物も同程度にDesmodesmus属緑藻無菌培養株に対して増殖促進活性を示した。③未分離未培養の殺藻細菌の検出とそれが生産する殺藻物質の同定 昨年度のメタゲノム解析の検討で殺藻現象に関与する未培養細菌の存在が示唆された。今年度は検体数を増やして統計的な解析を行うことで、再現性の確認を行った。同一条件の検体数を8とし、同様の試行を2回実施した。また、その際に得られる培養液には未培養菌が産生する活性物質が含まれると考えられており、1000 Lの殺藻後培養液から有機化合物の抽出する方法を確立した。④分離殺藻細菌からの殺藻物質および生合成遺伝子の同定 Stenotrophomonas属について活性物質の探索を行ったが、継代中に活性を失ったため、安定化の検討が必要と判断された。一方、Pseudomnas属細菌からは、過去に報告のあるpypluteorinおよびpseudopyronineとは異なる活性物質の産生が示唆されたためその精製を進めている。
期刊论文(15)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
殺藻細菌による赤潮・アオコの抑制:①殺藻物質の同定まで
利用杀藻菌抑制赤潮和蓝绿藻:(1)直到鉴定出杀藻物质
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
殺藻細菌 Pseudomonas sp. 58 の野生微細藻類に対する活性
杀藻细菌 Pseudomonas sp. 58 对野生微藻的活性
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [Shindo Aoi, Nishihara Gregory N., Borlongan Iris Ann, Terada Ryuta, H. Ikeda, 陳樹河]
通讯作者: 陳樹河
メタゲノム由来新規オートインデューサー様物質の生理活性
宏基因组学衍生的新型自诱导剂样物质的生理活性
DOI: --
发表时间: 2021
期刊:
影响因子: --
作者: [Sukeda M, Shiota K, Kondo M, Nagasawa T, Nakao M, Somamoto T, 池田 浩, 三輪俊太]
通讯作者: 三輪俊太
メタボロミクスを用いたアオコ殺藻細菌の機能解析
利用代谢组学分析蓝绿藻细菌的功能
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [Sato Yoichi, Nishihara Gregory N., Tanaka Atsuko, Belleza Dominic F. C., Kawate Azusa, Inoue Yukio, Hinode Kenjiro, Matsuda Yuhei, Tanimae Shinichiro, Tozaki Kandai, Terada Ryuta, Endo Hikaru, 羽賀美優]
通讯作者: 羽賀美優
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    メタゲノムおよびメタボローム解析を用いた実環境での殺藻細菌の機能解明
    • 批准号:
      23K20290
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $1.91万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      藤田 雅紀
    • 依托单位:
    Studies on metagenome derived novel QS signaling indole derivative
    • 批准号:
      23K18040
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
    • 资助金额:
      $4.16万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      藤田 雅紀
    • 依托单位:
    抗転移剤の開発を指向した海洋無脊椎動物からのプロテアーゼ阻害物質の探索
    • 批准号:
      01J05978
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $1.28万
    • 财政年份:
      2001
    • 负责人:
      藤田 雅紀
    • 依托单位:
    海外基金