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極低温超偏極固体NMRによる蛋白質の動的機能構造解析法の開発とGPCRへの応用

極低温超偏極固体NMRによる蛋白質の動的機能構造解析法の開発とGPCRへの応用
低温超极化固态NMR蛋白质动态功能结构分析方法的开发及其在GPCR中的应用
批准号:
20H03193
负责人:
松木 陽
金额:
$11.48万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-01 至 2024-03-31

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项目成果

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最終標的蛋白質のGPCR(β2アドレナリン受容体)について、無細胞系発現・精製・調製法を確立した。DOPC-コレステロール膜リポソームへの再構成、ラジオリガンドアッセイによるリガンド結合活性も確認した。固体NMR試料管へのパッキングを向上するのに、脂質量の最適化が必要であった。リガンドの結合に伴う構造変化を最も反映するヒンジ部位への選択的同位体標識スキームも設計し、主に主鎖構造アンサンブル平衡の観測に供する。これと並行してセレノメチオニン選択標識法も確立し、プロトン観測2次元 77Se-NMR信号の解析から、側鎖の構造アンサンブルに迫るアプローチも実行、学会発表した。GPCR以外の分子系で、やはり構造アンサンブルの動的平衡が機能発現に関与するモデル系として多剤排出系転写因子QacRの発現、精製も行った。QacRの微結晶状試料について、13C相関スペクトルの解析から動的平衡の存在が側鎖信号に捉えられることを見出し、学会発表した。高次元・残基間相関用のラジオ波パルス列も完成し、観測信号の質向上を目指した最適化を行った。装置の長期・超・安定性を得るために、微小な磁場不均一性を補正するシム電源の改良が必要であることも見出した。構造アンサンブルの計算科学的解析法については、データベースマイニングに則る基礎的な手法を確立し、モデル系αシヌクレインの液液相分離(LLPS)状態ドロップレット中の構造アンサンブル解析に応用した。成果は複数の学会発表、また論文として公表した。よりGPCRの解析に有用な解析法に発展させるため、DFTに基づく化学シフト計算をデータ解析に直接組み込む改良も行った。以上より、モデル系、標的蛋白質試料ともに試料調製、DNP-固体NMR測定法、解析法、いずれについても計画に沿って順調に発展させ、膜蛋白質の二重膜中、構造アンサンブル解析の基盤を作った。
期刊论文(29)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1039/d0cp05658h
发表时间: 2021-02-28
期刊: PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS
影响因子: 3.3
作者: [Matsuki, Yoh, Kobayashi, Takeshi, Fujiwara, Toshimichi]
通讯作者: Fujiwara, Toshimichi
生体系メソスケール構造研究に向けたDNP-NMR法
用于生物系统介观结构研究的 DNP-NMR 方法
DOI: --
发表时间: 2021
期刊:
影响因子: --
作者: [澤村友哉, 堀井和広, 椎名貴彦, 山口裕嗣, 山中章弘, 志水泰武, 松木 陽]
通讯作者: 松木 陽
細胞内構造生命科学にむけたDNP-MAS-NMRの装置・方法論開発と応用
细胞内结构生命科学DNP-MAS-NMR设备和方法的开发和应用
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [Yamaoki, Y., Nagata, T., Kondo, K., Sakamoto, T., Takami, S., and Katahira, M., 松木 陽]
通讯作者: 松木 陽
極低温MAS-DNP固体NMRによる多剤結合転写因子QacRの構造分布解析
低温 MAS-DNP 固态 NMR 分析多药结合转录因子 QacR 的结构分布
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [猪熊 壽, 原田俊之, 瀧口朝陽, 永田健樹, 佐伯陽平, 奥山一葉, 内山莉緒, 前澤誠希, チェンバーズ ジェームズ, 内田和幸, 田巻初,藤原敏道,松木陽]
通讯作者: 田巻初,藤原敏道,松木陽
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    GPCRと共役蛋白質の構造アンサンブル相関-擬細胞内環境DNP固体NMRの確立
    • 批准号:
      23K27115
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $7.57万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      松木 陽
    • 依托单位:
    GPCRと共役蛋白質の構造アンサンブル相関-擬細胞内環境DNP固体NMRの確立
    • 批准号:
      23H02422
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.98万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      松木 陽
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金
    适用膜蛋白-配体复合物结构测定的1H和19F距离约束检测的固体NMR方法研究
    • 批准号:
      JCZRYB202500181
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2025
    • 负责人:
    • 依托单位:
    锌基复合金属氧化物催化CO2加氢反应的固体NMR谱学研究
    超极化增强的固体NMR方法及在分子筛催化不饱和醛选择性加氢反应中的应用研究
    分子筛上生物质加氢脱氧反应协同催化作用的固体NMR研究