Development of the library programs for massively parallel calculation of fragment molecular orbital method
Development of the library programs for massively parallel calculation of fragment molecular orbital method
批准号:
22550015
负责人:
INADOMI Yuichi
金额:
$3.08万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2010
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2010 至 2012
中文摘要
为了对碎片分子轨道(FMO)方法进行有效的大规模并行计算,我们开发了FMO并行程序OpenFMO。此外,我们还探索了FMO程序的层次结构,并设计子程序(模块)的接口,以便于与计算机科学家和计算机工程师合作,提高并行FMO程序的性能。在本研究中,我们实现了高性能的FMO程序,并证实了它的高并行化效率。结果表明,本文设计和实现的模块可以在较短的时间内完成并行FMO程序的构建。
英文摘要
To carry out the effective massively parallel calculation of the fragment molecular orbital (FMO) method, we developed the parallel FMO program, OpenFMO. In addition, we probed the hierarchical structure of the FMO program and designed the interface of subprograms (modules) to make it easy to cooperate with the computer scientists and computer engineers to improve the performance of the parallel FMO program. In this study, we implemented the high performance FMO program and confirmed its high parallelization efficiency. And it was shown that the modules designed and implemented in this work was useful to construct the parallel FMO program in short time.
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OpenFMOにおけるフラグメント電子状態計算部分の高並列化
OpenFMO中碎片电子态计算部分高度并行化
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
影响因子:
--
作者:
[島崎真由子, 瀧上隆智(他2名), 稲富雄一]
通讯作者:
稲富雄一
並列FMOプログラムOpenFMOの超並列化への取り組み
并行 FMO 程序 OpenFMO 大规模并行化的努力
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
影响因子:
--
作者:
[T. Takamuku, T. Shimomura, M. Tachikawa, and R. Kanzaki, 稲富雄一]
通讯作者:
稲富雄一
フラグメント分子軌道法の高性能化
提高碎片分子轨道方法的性能
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[野路竜平, 小堀康博, 稲富雄一]
通讯作者:
稲富雄一
スーパーコンピュータ「京」におけるマスタ・ワーカ型プログラミングモデルの検討
超级计算机“K”主从编程模型研究
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[M.Shimasaki, T.Takiue, T.Shimomura, K. Komatsu, 高田 崇二郎, 村井均,南一生,横川三津夫,梅田宏明,佐藤三久,辻美和子,稲富雄一,青柳睦,中島真]
通讯作者:
村井均,南一生,横川三津夫,梅田宏明,佐藤三久,辻美和子,稲富雄一,青柳睦,中島真
並列FMOプログラムOpenFMOの超並列化
并行FMO程序OpenFMO的大规模并行化
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[K. Komatsu, A. Takamine, Y. Mizugai, and H. Maeda, 稲富雄一]
通讯作者:
稲富雄一
共 6 条
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