Erkennung doppelsträngiger RNA durch Zinkfingerproteine - NMR-spektroskopische Aufklärung von Struktur und Moleküldynamik

In diesem Projekt soll die interinteraction des Proteins dsRBP-ZFa（双链RNA结合蛋白-锌指a） mit doppelsträngiger RNA (dsRNA) untersucht werden。Das Protein dsRBP-ZFa和seine verwandten sind zinkfingerprotein， die eine wichtige Rolle bem programmiten Zelltod - der apoptosis spielen和micmicher Affinität和doppelsträngige RNA和RNA- dna - hybride binding。肿瘤抑制因子p53在前列腺癌和前列腺癌中的同源性，在前列腺癌和前列腺癌中的同源性，在前列腺癌中的同源性。k<s:1> nstlich hervorgerufene Überexpression与凋亡相关的dieer蛋白auslösen与肿瘤细胞病理学（z.B. Saos-2）Ein Konstrukt, das die ersten drei Zinkfingerdomänen von dsRBPZFa umfast (ZFa-zf123, 23 kDa) and zur Zeit im Labor . Prof. p.e. Dr. Wright实验。塞纳河三维结构与动力学研究进展Änderung durch Bindung和dsRNA在多维核磁共振光谱研究中的应用aufgeklärt werden。dsRNA-Part wid eine 15N/13C-markierte发夹- sequenz von 12-15 Basenparren Länge (~10 kDa) zum Einsatz kommen。Die neuen protein gehören zur family der Cys2His2-Zinkfinger, Die sehr häufig eine struckturr aus zwei b-Faltblättern and einer a-Helix ausbilden。核磁共振成像技术研究进展：<s:1>核磁共振成像技术研究进展：核磁共振成像技术研究进展：核磁共振成像技术研究进展。Im Gegensatz zu bekannten Zinkfingerproteinen besitzen die Mitglieder der neuen Proteinfamilien极端范围和可变连接子zwischen den zink - binding - indeendDomänen and einen vergrößerten abzwischen den zink - ordinierenden Histidinresten。Weiterhin ist ungewöhnlich， dass die wehselwirkung mit doppelsträngiger RNA night ber das in der literature bekante dsRNA结合motif stattfindet， sonder ber die Zinkfingerdomänen。Es könnte也in neuer Erkennungsmechanismus f<e:1> r dsRNA gefunden werden。

In diesem Projekt soll die Interaktion des Proteins dsRBP-ZFa (double stranded RNA binding protein-zinc finger a) mit doppelsträngiger RNA (dsRNA) untersucht werden. Das Protein dsRBP-ZFa und seine verwandten sind Zinkfingerproteine, die eine wichtige Rolle beim Programmierten Zelltod - der Apoptose spielen und mit hoher Affinität an doppelsträngige RNA und an RNA-DNA-Hybride binden. Homologe von dsRBP-ZFa werden im Menschen und in Nagern durch den Tumorsuppressor p53 induziert und in bestimmten Karzinomen, wie dem Plattenepithelzellkarzinom der Lunge, in erhöhter Konzentration gefunden. Künstlich hervorgerufene Überexpression dieser Proteine kann Apoptose auslösen und das Wachstum von Tumorzelllinien (z.B. Saos-2) hemmen. Ein Konstrukt, das die ersten drei Zinkfingerdomänen von dsRBPZFa umfasst (ZFa-zf123, 23 kDa) wird zur Zeit im Labor von Prof. Dr. P. E. Wright exprimiert. Seine 3D-Struktur und Dynamik sowie deren Änderung durch Bindung an dsRNA soll mit Hilfe von multidimensionaler NMR-Spektroskopie aufgeklärt werden. Als dsRNA-Part wird eine 15N/13C-markierte hairpin-Sequenz von 12-15 Basenparren Länge (~10 kDa) zum Einsatz kommen. Die neuen Proteine gehören zur Familie der Cys2His2-Zinkfinger, die sehr häufig eine Struktur aus zwei b-Faltblättern und einer a-Helix ausbilden. Da erste NMR-Experimente jedoch auf einen überraschend hohen a-helikalen Anteil hindeuten, liegt möglicherweise ein neues Faltungsmuster vor. Im Gegensatz zu bekannten Zinkfingerproteinen besitzen die Mitglieder der neuen Proteinfamilien extrem lange und hochvariable Linker zwischen den Zink-bindenden Domänen und einen vergrößerten Abstand zwischen den Zink-koordinierenden Histidinresten. Weiterhin ist ungewöhnlich, dass die Wechselwirkung mit doppelsträngiger RNA nicht über das in der Literatur bekannte dsRNA binding motif stattfindet, sondern über die Zinkfingerdomänen. Es könnte also ein neuer Erkennungsmechanismus für dsRNA gefunden werden.