课题基金 / 基金详情

副黄假单胞菌CRS01-1中新型天然产物的挖掘

批准号:
31700004
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
24.0 万元
负责人:
尹佳
依托单位:
学科分类:
微生物多样性、分类与系统发育
结题年份:
2020
批准年份:
2017
项目状态:
已结题
项目参与者:
王启业、陈汉娜、冀凤杰、刘东、靳赛赛

项目摘要

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项目成果

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中文摘要
微生物天然产物不仅用于人类和动物的疾病防控,在植物保护、作物增产等方面也贡献巨大。副黄假单胞菌CRS01-1是从水稻种子中分离到的植物病原菌广谱拮抗细菌,对水稻纹枯病原菌、稻种病原菌酸囊菌、水稻细菌性谷枯病原菌、水稻鞘褐腐病原菌和米曲霉等病原菌具有很好的拮抗效果,但迄今其拮抗机理未知。细菌的抗菌机理有很多种,其中产生的次生代谢产物是一个重要因素。CRS01-1基因组中存在多个次级代谢产物生物合成基因簇,这些次级代谢产物可能与其拮抗机制相关。本研究拟采用基因敲除、原位激活和异源表达的方法对该菌株中的新型天然产物合成基因簇进行挖掘,对新发现的天然活性产物进行结构鉴定和生物活性测定,从次级代谢产物角度阐释副黄假单胞菌拮抗病原菌的机理。同时发现结构新颖且活性突出的抗菌代谢产物,为开发新的抗菌药物提供更多宝贵的菌株资源,以及为其它生防菌中新型天然产物的挖掘提供参考和借鉴。
英文摘要
Microbial natural product plays an important role in disease prevention for humans, animals, plant protection and crop yield. Pseudomonas fulva CRS01-1 is a broad-spectrum antagonistic bacterium of plant pathogenic bacteria, and it shows antagonistic ability against Acidovorax avenae subsp.avenae (bacterial brown stripe), Burkholderia glumae (grain rot), Pseudomonas fuscovaginae (bacterial sheath brown rot), Rhizocto-nia solani (sheath blight) and Sitophilus oryzae (sheath rot), but its antagonistic mechanism is still unknown. Bacterial secondary metabolites have an important antibacterial mechanism. There are various secondary metabolites biosynthetic gene clusters presented in the CRS01-1 genome, and these secondary metabolites may be related to its antagonistic mechanism. In this study, the novel gene cluster of natural products was identified through gene knockout, in-situ activation and heterologous expression, and the target compounds can be isolated for structure elucidation and biological activity. Moreover, the antibacterial metabolites with novel structure and activity can provide valuable resources for the development of new antimicrobial agents and also provide the reference for the discovery of new natural products in other biocontrol agents.
微生物天然产物不仅用于人类和动物的疾病防控,在植物保护、作物增产等方面也贡献巨大。副黄假单胞菌CRS01-1是从水稻种子中分离到的植物病原菌广谱拮抗细菌,测序序列表明该菌含有多个次生代谢产物生物合成基因簇。本研究在CRS01-1中评估了一系列假单胞菌特异性重组系统(TEPsy、PluTEPsy、RedTEPsy、BAS、PluBAS和RedBAS)的重组效率,其中RedTEPsy具有最高的重组效率,并对该重组系统进行优化。通过高效基因重组系统,采用基因敲除和原位激活的方法,对四个BGC失活突变体和野生型CRS01-1提取物的LC-MS分析表明,BGC1和BGC2可以产生两种特定类别的化合物,根据核磁共振数据和氨基酸水解实验分析,这两种化合物确定为viscosin和massetolide B,生物信息学成功预测了它们的生物合成途径,更进一步的生物活性测定结果显示它们均对枯草芽孢杆菌有抑制活性。这些抗菌代谢产物的挖掘,为开发新的抗菌药物提供更多宝贵的菌株资源,以及为其它生防菌中新型天然产物的挖掘提供参考和借鉴。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Natural Products from Mammalian Gut Microbiota.
来自哺乳动物肠道微生物群的天然产物。
DOI: 10.1016/j.tibtech.2018.10.003
发表时间: 2019-05
期刊: Trends in Biotechnology
影响因子: 17.3
作者: [Wang Leli, Ravich, ran Vinothkannan, Yin Yulong, Yin Jia, Zhang Youming]
通讯作者: Zhang Youming
Single-Stranded DNA-Binding Protein and Exogenous RecBCD Inhibitors Enhance Phage-Derived Homologous Recombination in Pseudomonas
单链 DNA 结合蛋白和外源 RecBCD 抑制剂增强假单胞菌中噬菌体衍生的同源重组
DOI: 10.1016/j.isci.2019.03.007
发表时间: 2019-04-26
期刊: ISCIENCE
影响因子: 5.8
作者: [Yin, Jia, Zheng, Wentao, Fu, Jun]
通讯作者: Fu, Jun
DOI: 10.1186/s12866-020-01920-6
发表时间: 2020-07-28
期刊: BMC MICROBIOLOGY
影响因子: 4.2
作者: [Chen, Taohong, Wang, Leli, Yin, Yulong]
通讯作者: Yin, Yulong
Engineering Pseudomonas protegens Pf-5 to improve its antifungal activity and nitrogen fixation
对保护假单胞菌 Pfâ5 进行工程改造以提高其抗真菌活性和固氮作用
DOI: 10.1111/1751-7915.13335
发表时间: 2020-01-01
期刊: MICROBIAL BIOTECHNOLOGY
影响因子: 5.7
作者: [Jing, Xiaoshu, Cui, Qingwen, Zhang, Youming]
通讯作者: Zhang, Youming
共 6 条
    RNF152响应Proline降低机体氧化应激在缓解慢性阻塞性肺病中的分子机制研究
    • 批准号:
      32471200
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      50.00万元
    • 批准年份:
      2024
    • 负责人:
      尹佳
    • 依托单位:
    戊糖片球菌调控断奶仔猪肠道氧化应激代谢产物的挖掘
    • 批准号:
      2023JJ10029
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      0.0万元
    • 批准年份:
      2023
    • 负责人:
      尹佳
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金