Mapping Protein Targets of Bioactive Small Molecules Using Lipid-Based Chemical Proteomics.
Mapping Protein Targets of Bioactive Small Molecules Using Lipid-Based Chemical Proteomics.
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DOI：
10.1021/acschembio.7b00581
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发表时间：
2017-10-20
影响因子：
4
通讯作者：
Cravatt BF
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Lum KM;Sato Y;Beyer BA;Plaisted WC;Anglin JL;Lairson LL;Cravatt BF
脂质在细胞生物学中起着至关重要的作用，通常通过与蛋白质的直接相互作用。我们最近描述了使用光反应性脂质探针结合定量质谱法来全局绘制脂质-蛋白相互作用，以及药物对细胞中这些相互作用的影响。在这里，我们研究了基于脂质的化学蛋白质组学探针在确定生物活性小分子的细胞靶标方面的更广泛的潜力，包括天然产物衍生物和机制不明确的重新用途药物。我们确定了前列腺素调节酶PTGR2作为抗糖尿病酒花衍生物KDT501的靶标，并表明米康唑（一种抗真菌药物，可减轻多发性硬化症临床前模型中的疾病严重程度）抑制SGPL1，一种降解信号脂质磷脂-1-磷酸的酶，其药物类似物用于治疗人类多发性硬化症。我们的研究结果强调了基于脂质的化学蛋白质组学探针的多功能性，用于绘制人类细胞中小分子-蛋白质相互作用，以获得对生物活性化合物的机制理解。
Lipids play critical roles in cell biology, often through direct interactions with proteins. We recently described the use of photoreactive lipid probes combined with quantitative mass spectrometry to globally map lipid-protein interactions, and the effects of drugs on these interactions, in cells. Here, we investigate the broader potential of lipid-based chemical proteomic probes for determining the cellular targets of biologically active small molecules, including natural product derivatives and repurposed drugs of ill-defined mechanisms. We identify the prostaglandin-regulatory enzyme PTGR2 as a target of the anti-diabetic hops derivative KDT501 and show that miconazole—an anti-fungal drug that attenuates disease severity in preclinical models of multiple sclerosis—inhibits SGPL1, an enzyme that degrades the signaling lipid sphingosine-1-phosphate, drug analogues of which are used to treat multiple sclerosis in humans. Our findings highlight the versatility of lipid-based chemical proteomics probes for mapping small molecule-protein interactions in human cells to gain mechanistic understanding of bioactive compounds.
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影响因子：
64.5
作者：
Parker CG;Galmozzi A;Wang Y;Correia BE;Sasaki K;Joslyn CM;Kim AS;Cavallaro CL;Lawrence RM;Johnson SR;Narvaiza I;Saez E;Cravatt BF
通讯作者：
Cravatt BF
影响因子：
15
作者：
Kambe T;Correia BE;Niphakis MJ;Cravatt BF
通讯作者：
Cravatt BF
DOI：
10.1016/j.bbalip.2017.04.006
发表时间：
2017-08
期刊：
Biochimica et biophysica acta. Molecular and cell biology of lipids
影响因子：
--
作者：
Gross RW
通讯作者：
Gross RW
影响因子：
9.3
作者：
Jackson SJ;Giovannoni G;Baker D
通讯作者：
Baker D
DOI：
10.1073/pnas.1611096114
发表时间：
2017-02-14
影响因子：
11.1
作者：
Hoeglinger, Doris;Nadler, Andre;Schultz, Carsten
通讯作者：
Schultz, Carsten