New insights into the functional role of retrotransposon dynamics in mammalian somatic cells.
New insights into the functional role of retrotransposon dynamics in mammalian somatic cells.
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DOI：
10.1007/s00018-021-03851-5
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发表时间：
2021-07
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Orlando V
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Mangiavacchi A;Liu P;Della Valle F;Orlando V
反转录转座子是存在于所有真核生物基因组中的遗传元件。虽然它们在进化中的作用被认为是潜在有益的遗传变异的自然来源，但它们的活动被经典地认为是有害的，因为它们对基因组稳定性有潜在的有害影响。然而，研究越来越多地阐明了在非病理情况下，体细胞逆转录因子重新激活的调节功能和有益作用。在这里，我们回顾了最近的发现，揭示了逆转录转座子的调节潜力，包括它们在非编码RNA转录中的作用，作为哺乳动物转录和表观基因组景观的调节器。我们还讨论了在破译逆转座子元件的多方面活动方面的技术挑战，强调了基因组中这一被忽视的部分在早期发育和成年生活中所发挥的不可预见的核心作用。
Retrotransposons are genetic elements present across all eukaryotic genomes. While their role in evolution is considered as a potentially beneficial natural source of genetic variation, their activity is classically considered detrimental due to their potentially harmful effects on genome stability. However, studies are increasingly shedding light on the regulatory function and beneficial role of somatic retroelement reactivation in non-pathological contexts. Here, we review recent findings unveiling the regulatory potential of retrotransposons, including their role in noncoding RNA transcription, as modulators of mammalian transcriptional and epigenome landscapes. We also discuss technical challenges in deciphering the multifaceted activity of retrotransposable elements, highlighting an unforeseen central role of this neglected portion of the genome both in early development and in adult life.
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影响因子：
64.8
作者：
Carrieri, Claudia;Cimatti, Laura;Gustincich, Stefano
通讯作者：
Gustincich, Stefano
影响因子：
16
作者：
Calo, Eliezer;Wysocka, Joanna
通讯作者：
Wysocka, Joanna
影响因子：
30.8
作者：
Dewannieux, M;Esnault, C;Heidmann, T
通讯作者：
Heidmann, T
DOI：
10.1126/science.aad5497
发表时间：
2016-03-04
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Chuong EB;Elde NC;Feschotte C
通讯作者：
Feschotte C
影响因子：
64.5
作者：
Batra R;Nelles DA;Pirie E;Blue SM;Marina RJ;Wang H;Chaim IA;Thomas JD;Zhang N;Nguyen V;Aigner S;Markmiller S;Xia G;Corbett KD;Swanson MS;Yeo GW
通讯作者：
Yeo GW