Modification of enhancer chromatin: what, how, and why?
Modification of enhancer chromatin: what, how, and why?
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DOI：
10.1016/j.molcel.2013.01.038
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发表时间：
2013-03-07
期刊：
影响因子：
16
通讯作者：
Wysocka, Joanna
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Calo, Eliezer;Wysocka, Joanna
胚胎发生过程中形式和功能的出现大部分通过基因表达模式中的细胞类型和细胞状态特异性变异，这是由称为增强子的专用顺式调节元素介导的。最近的大型表观基因组映射显示出意外的复杂性和增强剂利用模式的动态，仅编码项目就会注入40万个假定的人类增强剂。这些大规模的努力在很大程度上是通过理解，即增强剂具有某些刻板印象的染色质特征。但是，一个重要的问题仍然存在：增强剂染色质修饰的功能意义是什么？在这里，我们概述了组蛋白和DNA的增强子相关的修饰，并讨论与其动态沉积和去除有关的酶促活性。我们描述了这些标记的潜在下游效应子，并提出了用于探索染色质修饰功能在调节开发过程中增强剂活性方面的功能的模型。
Emergence of form and function during embryogenesis arises in large part through cell type- and cell state- specific variation in gene expression patterns, mediated by specialized cis-regulatory elements called enhancers. Recent large-scale epigenomic mapping revealed unexpected complexity and dynamics of enhancer utilization patterns, with 400,000 putative human enhancers annotated by the ENCODE project alone. These large-scale efforts were largely enabled through understanding that enhancers share certain stereotypical chromatin features. However, an important question still lingers: What is the functional significance of enhancer chromatin modification? Here we give an overview of enhancer-associated modifications of histones and DNA, and discuss enzymatic activities involved in their dynamic deposition and removal. We describe potential downstream effectors of these marks and propose models for exploring functions of chromatin modification in regulating enhancer activity during development.
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影响因子：
64.8
作者：
Ernst, Jason;Kheradpour, Pouya;Mikkelsen, Tarjei S.;Shoresh, Noam;Ward, Lucas D.;Epstein, Charles B.;Zhang, Xiaolan;Wang, Li;Issner, Robbyn;Coyne, Michael;Ku, Manching;Durham, Timothy;Kellis, Manolis;Bernstein, Bradley E.
通讯作者：
Bernstein, Bradley E.
影响因子：
4.5
作者：
Adhvaryu, Keyur K.;Berge, Emanuela;Selker, Eric U.
通讯作者：
Selker, Eric U.
影响因子：
4.8
作者：
Altaf, Mohammed;Auger, Andreanne;Cote, Jacques
通讯作者：
Cote, Jacques
影响因子：
10.5
作者：
Clouaire, Thomas;Webb, Shaun;Bird, Adrian
通讯作者：
Bird, Adrian
影响因子：
11.4
作者：
Buecker, Christa;Wysocka, Joanna
通讯作者：
Wysocka, Joanna