Organizational principles of 3D genome architecture.
Organizational principles of 3D genome architecture.
复制标题
DOI：
10.1038/s41576-018-0060-8
复制
发表时间：
2018-12
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Corces VG
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Rowley MJ;Corces VG
3D染色质组织的研究表明，染色体是分层组织成由较小的域组成的大隔间，称为TADs。最近的证据表明，隔室比以前认为的要小，并且转录或染色质状态负责相互作用，导致所有生物体中小隔室结构域的形成。在脊椎动物中，CTCF形成环结构域，可能是通过涉及粘附素的挤出过程。CTCF环与区室结构域相互作用以建立基因组的3D组织。染色质纤维的连续挤压也可能是负责建立增强子-启动子相互作用和随机方面的转录过程。这些观察结果表明，基因组的3D组织可能不仅仅是一个决定因素，也是其功能的结果。
Studies of 3D chromatin organization have suggested that chromosomes are hierarchically organized into large compartments composed of smaller domains called TADs. Recent evidence suggests that compartments are smaller than previously thought and that the transcriptional or chromatin state is responsible for interactions leading to the formation of small compartmental domains in all organisms. In vertebrates CTCF forms loop domains, likely via an extrusion process involving cohesin. CTCF loops interact with compartmental domains to establish the 3D organization of the genome. The continuous extrusion of the chromatin fiber by cohesin may also be responsible for the establishment of enhancer-promoter interactions and stochastic aspects of the transcription process. These observations suggest that the 3D organization of the genome may not be just a determinant, but also a consequence of its function.
登录
查看更多内容
DOI：
10.1126/science.aar7831
发表时间：
2018-04-06
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Ganji M;Shaltiel IA;Bisht S;Kim E;Kalichava A;Haering CH;Dekker C
通讯作者：
Dekker C
影响因子：
3.5
作者：
Cubeñas-Potts C;Corces VG
通讯作者：
Corces VG
影响因子：
19
作者：
Gligoris T;Löwe J
通讯作者：
Löwe J
影响因子：
14.9
作者：
Cubeñas-Potts C;Rowley MJ;Lyu X;Li G;Lei EP;Corces VG
通讯作者：
Corces VG
影响因子：
64.5
作者：
Dowen JM;Fan ZP;Hnisz D;Ren G;Abraham BJ;Zhang LN;Weintraub AS;Schujiers J;Lee TI;Zhao K;Young RA
通讯作者：
Young RA