Catabolic Reductive Dehalogenase Substrate Complex Structures Underpin Rational Repurposing of Substrate Scope.
Catabolic Reductive Dehalogenase Substrate Complex Structures Underpin Rational Repurposing of Substrate Scope.
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DOI：
10.3390/microorganisms8091344
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发表时间：
2020-09-02
期刊：
影响因子：
4.5
通讯作者：
Leys D
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Halliwell T;Fisher K;Payne KAP;Rigby SEJ;Leys D
还原性脱卤酶负责有机卤化物呼吸过程中碳-卤素键的还原性裂解。对于这些含有钴胺素和[4Fe-4S]的酶，已经提出了多种机制，包括基于有机钴、自由基或钴卤化物加合物的催化。后者被提议用于耐氧 Nitratireductor pacificus pht-3B 分解代谢还原脱卤酶 (NpRdhA)。在这里，我们提出了第一个底物结合的 NpRdhA 晶体结构，证实了直接的钴-卤素相互作用的建立，并为底物偏好提供了理论依据。由于 X 射线光还原，在晶体中观察到产物形成。蛋白质工程能够合理改变底物偏好，为该酶和相关酶在生物修复中的应用提供未来蓝图。
Reductive dehalogenases are responsible for the reductive cleavage of carbon-halogen bonds during organohalide respiration. A variety of mechanisms have been proposed for these cobalamin and [4Fe-4S] containing enzymes, including organocobalt, radical, or cobalt-halide adduct based catalysis. The latter was proposed for the oxygen-tolerant Nitratireductor pacificus pht-3B catabolic reductive dehalogenase (NpRdhA). Here, we present the first substrate bound NpRdhA crystal structures, confirming a direct cobalt–halogen interaction is established and providing a rationale for substrate preference. Product formation is observed in crystallo due to X-ray photoreduction. Protein engineering enables rational alteration of substrate preference, providing a future blue print for the application of this and related enzymes in bioremediation.
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DOI：
10.1107/s0907444904019158
发表时间：
2004-12-01
影响因子：
2.2
作者：
Emsley, P;Cowtan, K
通讯作者：
Cowtan, K
DOI：
10.1107/s0907444909052925
发表时间：
2010-02
期刊：
Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography
影响因子：
--
作者：
Adams PD;Afonine PV;Bunkóczi G;Chen VB;Davis IW;Echols N;Headd JJ;Hung LW;Kapral GJ;Grosse-Kunstleve RW;McCoy AJ;Moriarty NW;Oeffner R;Read RJ;Richardson DC;Richardson JS;Terwilliger TC;Zwart PH
通讯作者：
Zwart PH
影响因子：
16.8
作者：
Jamieson, Alan J.;Malkocs, Tamas;Zhang, Zulin
通讯作者：
Zhang, Zulin
影响因子：
3.6
作者：
Chen, Kai;Huang, Linglong;Jiang, Jiandong
通讯作者：
Jiang, Jiandong
影响因子：
5.2
作者：
Jugder BE;Ertan H;Bohl S;Lee M;Marquis CP;Manefield M
通讯作者：
Manefield M