Interactive Tree Of Life (iTOL) v5: an online tool for phylogenetic tree display and annotation.
Interactive Tree Of Life (iTOL) v5: an online tool for phylogenetic tree display and annotation.
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DOI：
10.1093/nar/gkab301
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发表时间：
2021-07-02
影响因子：
14.9
通讯作者：
Bork P
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Letunic I;Bork P
互动生命树(https://itol.embl.de))是一个在线工具，用于显示、操作和注释系统发育和其他树。它是免费提供的，对所有人开放。ITOL版本5引入了一个全新的树显示引擎，以及许多新功能。例如，增加了一种新的数据集类型(Meme Motif)，同时为几个现有的数据集扩展了注释选项。节点元数据显示选项已扩展，现在还支持非数字类别值，以及每个节点多个值。现在提供了直接的手动注释，提供了一套基本的绘图和标签工具，允许用户直接在树上手工绘制形状、标签和其他特征。扩展了对树和数据集比例的支持，提供了对线和标签样式的精细控制。无根树显示现在可以使用等日光算法，从而证明显示清晰度要高得多。用户帐户系统经过简化和扩展，增加了新的导航选项，目前可处理来自70,000名个人用户的1百万棵树。ITOL：一个用于树显示和注释的在线工具。
The Interactive Tree Of Life (https://itol.embl.de) is an online tool for the display, manipulation and annotation of phylogenetic and other trees. It is freely available and open to everyone. iTOL version 5 introduces a completely new tree display engine, together with numerous new features. For example, a new dataset type has been added (MEME motifs), while annotation options have been expanded for several existing ones. Node metadata display options have been extended and now also support non-numerical categorical values, as well as multiple values per node. Direct manual annotation is now available, providing a set of basic drawing and labeling tools, allowing users to draw shapes, labels and other features by hand directly onto the trees. Support for tree and dataset scales has been extended, providing fine control over line and label styles. Unrooted tree displays can now use the equal-daylight algorithm, proving a much greater display clarity. The user account system has been streamlined and expanded with new navigation options and currently handles >1 million trees from >70 000 individual users. iTOL: an online tool for the tree display and annotation.
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影响因子：
5.8
作者：
Zmasek, CM;Eddy, SR
通讯作者：
Eddy, SR
DOI：
10.1007/978-1-4939-6685-1_9
发表时间：
2017-01-01
期刊：
ORAL BIOLOGY: MOLECULAR TECHNIQUES AND APPLICATIONS, 2ND EDITION
影响因子：
--
作者：
Lawley, Blair;Tannock, Gerald W.
通讯作者：
Tannock, Gerald W.
MrBayes tgMC(3)：一种高性能且资源高效的面向GPU的系统发育分析方法
DOI：
10.1109/tcbb.2015.2495202
发表时间：
2016-09-01
影响因子：
4.5
作者：
Ling, Cheng;Hamada, Tsuyoshi;Shi, Weifeng
通讯作者：
Shi, Weifeng
影响因子：
14.9
作者：
Bailey TL;Johnson J;Grant CE;Noble WS
通讯作者：
Noble WS
影响因子：
3
作者：
Han MV;Zmasek CM
通讯作者：
Zmasek CM