Unconventional miR-122 binding stabilizes the HCV genome by forming a trimolecular RNA structure.
Unconventional miR-122 binding stabilizes the HCV genome by forming a trimolecular RNA structure.
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DOI：
10.1093/nar/gkt075
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发表时间：
2013-04
影响因子：
14.9
通讯作者：
Doudna JA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Mortimer SA;Doudna JA
microRNA（miRNAs）通常通过miRNAs的5′“种子”区和mRNA的3′非翻译区（3′UTR）之间有限的碱基配对相互作用来下调靶mRNA的蛋白质表达。与这种既定的作用模式相反，肝脏特异性人miR-122在丙型肝炎病毒（HCV）5′UTR内的两个位点结合，导致感染性病毒体的产生增加。我们发现两个拷贝的miR-122与HCV 5′UTR在病毒转录本5′端附近的部分重叠位置相互作用，形成稳定的三元复合物。两个miR-122结合位点都涉及种子序列外的广泛碱基配对;然而，它们具有显著不同的相互作用亲和力。结构探测揭示了HCV 5′UTR与miR-122相互作用时发生的结构变化。然而，与以前的报道相反，使用重组胞质核酸外切酶Xrn 1和肝细胞提取物的结果表明，miR-122介导的HCV RNA降解保护与体内病毒繁殖的刺激无关。因此，miR-122：HCV三元复合物可能在病毒生命周期的其他关键步骤中发挥作用。
MicroRNAs (miRNAs) typically downregulate protein expression from target mRNAs through limited base-pairing interactions between the 5′ ‘seed’ region of the miRNA and the mRNA 3′ untranslated region (3′UTR). In contrast to this established mode of action, the liver-specific human miR-122 binds at two sites within the hepatitis C viral (HCV) 5′UTR, leading to increased production of infectious virions. We show here that two copies of miR-122 interact with the HCV 5′UTR at partially overlapping positions near the 5′ end of the viral transcript to form a stable ternary complex. Both miR-122 binding sites involve extensive base pairing outside of the seed sequence; yet, they have substantially different interaction affinities. Structural probing reveals changes in the architecture of the HCV 5′UTR that occur on interaction with miR-122. In contrast to previous reports, however, results using both the recombinant cytoplasmic exonuclease Xrn1 and liver cell extracts show that miR-122-mediated protection of the HCV RNA from degradation does not correlate with stimulation of viral propagation in vivo. Thus, the miR-122:HCV ternary complex likely functions at other steps critical to the viral life cycle.
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影响因子：
5.7
作者：
Berry, Katherine E.;Waghray, Shruti;Doudna, Jennifer A.
通讯作者：
Doudna, Jennifer A.
影响因子：
56.9
作者：
Jopling, CL;Yi, MK;Sarnow, P
通讯作者：
Sarnow, P
DOI：
10.1038/nsb1004
发表时间：
2003-12-01
期刊：
NATURE STRUCTURAL BIOLOGY
影响因子：
--
作者：
Lukavsky, PJ;Kim, I;Puglisi, JD
通讯作者：
Puglisi, JD
影响因子：
5.4
作者：
Shimakami, Tetsuro;Yamane, Daisuke;Lemon, Stanley M.
通讯作者：
Lemon, Stanley M.
DOI：
10.1073/pnas.1012464108
发表时间：
2011-02-22
影响因子：
11.1
作者：
Machlin, Erica S.;Sarnow, Peter;Sagan, Selena M.
通讯作者：
Sagan, Selena M.