Methods in DNA methylation profiling.
Methods in DNA methylation profiling.
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DOI：
10.2217/epi.09.31
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发表时间：
2009-12
期刊：
影响因子：
3.8
通讯作者：
Huang TH
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zuo T;Tycko B;Liu TM;Lin JJ;Huang TH
DNA甲基化的亚稳态和体细胞遗传模式提供了重要的基因组调控水平。在这篇文章中，我们回顾了分析这些全基因组表观遗传模式的方法，并提供了一个不断扩大的文献，我们希望这将是有用的调查人员谁是新的这一领域的观点。我们所涵盖的历史方面将有助于解释这些文献，我们希望我们对最新分析方法的讨论将促进未来的进展。我们强调，没有一种方法可以提供整体甲基化组的完整视图，并且应用于同一样本集的多种方法的组合将提供最清晰的图像。鉴于最近的研究发现了意想不到的表观基因组模式和新的生物学原理，以及新的疾病标志物，很可能会继续使用全基因组DNA甲基化谱进行重要的发现。
Metastable and somatically heritable patterns of DNA methylation provide an important level of genomic regulation. In this article, we review methods for analyzing these genome-wide epigenetic patterns and offer a perspective on the ever-expanding literature, which we hope will be useful for investigators who are new to this area. The historical aspects that we cover will be helpful in interpreting this literature and we hope that our discussion of the newest analytical methods will stimulate future progress. We emphasize that no single approach can provide a complete view of the overall methylome, and that combinations of several modalities applied to the same sample set will give the clearest picture. Given the unexpected epigenomic patterns and new biological principles, as well as new disease markers, that have been uncovered in recent studies, it is likely that important discoveries will continue to be made using genome-wide DNA methylation profiling.
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影响因子：
46.9
作者：
Ball, Madeleine P.;Li, Jin Billy;Gao, Yuan;Lee, Je-Hyuk;LeProust, Emily M.;Park, In-Hyun;Xie, Bin;Daley, George Q.;Church, George M.
通讯作者：
Church, George M.
影响因子：
46.9
作者：
Deng, Jie;Shoemaker, Robert;Xie, Bin;Gore, Athurva;LeProust, Emily M.;Antosiewicz-Bourget, Jessica;Egli, Dieter;Maherali, Nimet;Park, In-Hyun;Yu, Junying;Daley, George Q.;Eggan, Kevin;Hochedlinger, Konrad;Thomson, James;Wang, Wei;Gao, Yuan;Zhang, Kun
通讯作者：
Zhang, Kun
影响因子：
11.2
作者：
Ehrich, Mathias;Field, John K.;van den Boom, Dirk
通讯作者：
van den Boom, Dirk
影响因子：
14.9
作者：
Adorján, P;Distler, J;Olek, A
通讯作者：
Olek, A
影响因子：
56.9
作者：
Gaudet, F;Hodgson, JG;Jaenisch, R
通讯作者：
Jaenisch, R