Single-cell RNA sequencing of adult mouse testes.
Single-cell RNA sequencing of adult mouse testes.
复制标题
成年小鼠睾丸单细胞RNA测序。
DOI：
10.1038/sdata.2018.192
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发表时间：
2018-09-11
期刊：
影响因子：
9.8
通讯作者：
Winterpacht A
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Lukassen S;Bosch E;Ekici AB;Winterpacht A
精子发生是一个高效而复杂的细胞连续分化系统。以前研究睾丸中不同细胞群的转录组依赖于分选细胞、细胞耗竭或未完成精子发生所有阶段的幼年动物。我们展示了来自两只8周龄C57 Bl/6 J小鼠睾丸的2，500个细胞的单细胞RNA测序（scRNA-Seq）数据。我们的数据集包括所有的生精阶段，从细线期前到凝聚精子细胞以及单个精原细胞，支持细胞和间质细胞。这些数据捕获了精子发生的减数分裂和减数分裂后阶段的完整连续性，因此非常适合于标记发现，网络推理和类似的分析，可以利用分化过程的时间顺序。此外，它可以作为未来研究的参考，涉及精子发生受到干扰的小鼠单细胞RNA-Seq。
Spermatogenesis is an efficient and complex system of continuous cell differentiation. Previous studies investigating the transcriptomes of different cell populations in the testis relied either on sorting cells, cell depletion, or juvenile animals where not all stages of spermatogenesis have been completed. We present single-cell RNA sequencing (scRNA-Seq) data of 2,500 cells from the testes of two 8-week-old C57Bl/6J mice. Our dataset includes all spermatogenic stages from preleptotene to condensing spermatids as well as individual spermatogonia, Sertoli and Leydig cells. The data capture the full continuity of the meiotic and postmeiotic stages of spermatogenesis, and is thus ideally suited for marker discovery, network inference and similar analyses for which temporal ordering of differentiation processes can be exploited. Furthermore, it can serve as a reference for future studies involving single-cell RNA-Seq in mice where spermatogenesis is perturbed.
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