The connectome mapper: an open-source processing pipeline to map connectomes with MRI.
The connectome mapper: an open-source processing pipeline to map connectomes with MRI.
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DOI：
10.1371/journal.pone.0048121
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发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
Thiran JP
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Daducci A;Gerhard S;Griffa A;Lemkaddem A;Cammoun L;Gigandet X;Meuli R;Hagmann P;Thiran JP
在使用扩散磁共振成像（MRI）进行全球连通性分析领域工作的研究人员可以依靠广泛的软件包来处理他们的数据，方法从局部体素内轴突结构的重建到底层纤维束轨迹的估计。但是，每个包通常都是特定于任务的，并使用自己的约定和文件格式。在这篇文章中，我们介绍了Connectome Mapper，这是一个软件管道，旨在帮助研究人员通过组织，处理和分析弥散MRI数据的繁琐过程来进行全球大脑连接分析。我们的管道是用Python编写的，可以在www.cmtk.org上免费获得。
Researchers working in the field of global connectivity analysis using diffusion magnetic resonance imaging (MRI) can count on a wide selection of software packages for processing their data, with methods ranging from the reconstruction of the local intra-voxel axonal structure to the estimation of the trajectories of the underlying fibre tracts. However, each package is generally task-specific and uses its own conventions and file formats. In this article we present the Connectome Mapper, a software pipeline aimed at helping researchers through the tedious process of organising, processing and analysing diffusion MRI data to perform global brain connectivity analyses. Our pipeline is written in Python and is freely available as open-source at www.cmtk.org.
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影响因子：
5.3
作者：
Achard, S;Salvador, R;Bullmore, ET
通讯作者：
Bullmore, ET
影响因子：
3.5
作者：
Gorgolewski K;Burns CD;Madison C;Clark D;Halchenko YO;Waskom ML;Ghosh SS
通讯作者：
Ghosh SS
影响因子：
3.7
作者：
Hagmann, Patric;Kurant, Maciej;Gigandet, Xavier;Thiran, Patrick;Wedeen, Van J.;Meuli, Reto;Thiran, Jean-Philippe
通讯作者：
Thiran, Jean-Philippe
影响因子：
2.1
作者：
Oliphant, Travis E.
通讯作者：
Oliphant, Travis E.
DOI：
10.1016/j.jmr.2011.09.022
发表时间：
1996-06-01
期刊：
JOURNAL OF MAGNETIC RESONANCE SERIES B
影响因子：
--
作者：
Basser, PJ;Pierpaoli, C
通讯作者：
Pierpaoli, C