The complete chloroplast genome sequence of Stilpnolepis centiflora (Asteraceae), an endemic desert species in Northern China.
The complete chloroplast genome sequence of Stilpnolepis centiflora (Asteraceae), an endemic desert species in Northern China.
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中国北方特有荒漠物种Stilpnolepis centiflora（菊科）叶绿体基因组全序列
DOI：
10.1080/23802359.2020.1829127
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发表时间：
2020-10-09
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Xie K
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Shi X;Xie K
中文摘要中国野蕨属菊科单种属，是我国北方荒漠特有植物。然而，该物种的叶绿体（cp）基因组的信息是有限的。本研究中，我们获得了S.通过高通量下一代测序技术获得。cp基因组全长151017 bp，由133个基因组成，其中蛋白质编码基因88个，tRNA基因37个，rRNA基因8个。色葡萄centiflora cp基因组的GC含量为37.35%。系统发育树分析表明，S. centiflora与蒿属和菊属的分类单元关系密切。本研究结果将有助于紫菀属植物的种间鉴定和系统发育研究。
Abstract Stilpnolepis centiflora, a monotypic genus of the Asteraceae, is an endemic desert species in Northern China. However, information on the chloroplast (cp) genome of this species is limited. In this study, we present the complete chloroplast genome sequence of S. centiflora obtained by high-throughput nextgeneration sequencing technology. The whole cp genome was 151017 bp long and comprised 133 genes, including 88 proteincoding genes, 37 tRNA genes, and 8 rRNA genes. The S. centiflora cp genome had a GC content of 37.35%. Phylogenetic tree revealed that S. centiflora was closely related to the taxa in the genus Artemisia and Chrysanthemum. Our results would be helpful for species identification and promote our understanding of the phylogeny of Stilpnolepis within the Asteraceae family.
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