BioPortal: enhanced functionality via new Web services from the National Center for Biomedical Ontology to access and use ontologies in software applications.
BioPortal: enhanced functionality via new Web services from the National Center for Biomedical Ontology to access and use ontologies in software applications.
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DOI：
10.1093/nar/gkr469
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发表时间：
2011-07
影响因子：
14.9
通讯作者：
Musen MA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Whetzel PL;Noy NF;Shah NH;Alexander PR;Nyulas C;Tudorache T;Musen MA
国家生物医学本体中心（NCBO）是由NIH路线图倡议资助的国家生物医学计算中心之一。NCBO为国家计算基础设施做出了贡献，开发了biopportal，这是一个通过NCBO网络服务提供访问生物医学本体和术语库的门户网站（http://bioportal.bioontology.org）。biopportal通过提供添加术语之间的映射、添加链接到特定本体术语的注释以及提供本体评论等功能，使社区能够参与本体内容的评估和演变。NCBO Web服务（http://www.bioontology.org/wiki/index.php/NCBO_REST_services）支持此功能，并提供统一的机制来访问来自各种知识表示格式的本体，例如Web本体语言（OWL）和开放生物学和生物医学本体（OBO）格式。Web服务提供对本体内容的多层访问，从获取本体中的所有术语到检索关于某个术语的元数据。用户可以很容易地将NCBO Web服务合并到软件应用程序中，以生成语义感知的应用程序，并促进结构化数据收集。
The National Center for Biomedical Ontology (NCBO) is one of the National Centers for Biomedical Computing funded under the NIH Roadmap Initiative. Contributing to the national computing infrastructure, NCBO has developed BioPortal, a web portal that provides access to a library of biomedical ontologies and terminologies (http://bioportal.bioontology.org) via the NCBO Web services. BioPortal enables community participation in the evaluation and evolution of ontology content by providing features to add mappings between terms, to add comments linked to specific ontology terms and to provide ontology reviews. The NCBO Web services (http://www.bioontology.org/wiki/index.php/NCBO_REST_services) enable this functionality and provide a uniform mechanism to access ontologies from a variety of knowledge representation formats, such as Web Ontology Language (OWL) and Open Biological and Biomedical Ontologies (OBO) format. The Web services provide multi-layered access to the ontology content, from getting all terms in an ontology to retrieving metadata about a term. Users can easily incorporate the NCBO Web services into software applications to generate semantically aware applications and to facilitate structured data collection.
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影响因子：
14.9
作者：
Gallo SM;Gerrard DT;Miner D;Simich M;Des Soye B;Bergman CM;Halfon MS
通讯作者：
Halfon MS
影响因子：
14.9
作者：
Noy NF;Shah NH;Whetzel PL;Dai B;Dorf M;Griffith N;Jonquet C;Rubin DL;Storey MA;Chute CG;Musen MA
通讯作者：
Musen MA
影响因子：
1.9
作者：
Jonquet C;Musen MA;Shah NH
通讯作者：
Shah NH
影响因子：
64.8
作者：
Howe, Doug;Costanzo, Maria;Fey, Petra;Gojobori, Takashi;Hannick, Linda;Hide, Winston;Hill, David P.;Kania, Renate;Schaeffer, Mary;St Pierre, Susan;Twigger, Simon;White, Owen;Rhee, Seung Yon
通讯作者：
Rhee, Seung Yon
DOI：
10.1093/bioinformatics/btq415
发表时间：
2010-09-15
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Rocca-Serra P;Brandizi M;Maguire E;Sklyar N;Taylor C;Begley K;Field D;Harris S;Hide W;Hofmann O;Neumann S;Sterk P;Tong W;Sansone SA
通讯作者：
Sansone SA