A census of human soluble protein complexes.
A census of human soluble protein complexes.
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DOI：
10.1016/j.cell.2012.08.011
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发表时间：
2012-08-31
期刊：
影响因子：
64.5
通讯作者：
Emili A
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Havugimana PC;Hart GT;Nepusz T;Yang H;Turinsky AL;Li Z;Wang PI;Boutz DR;Fong V;Phanse S;Babu M;Craig SA;Hu P;Wan C;Vlasblom J;Dar VU;Bezginov A;Clark GW;Wu GC;Wodak SJ;Tillier ER;Paccanaro A;Marcotte EM;Emili A
细胞过程通常依赖于蛋白质之间稳定的物理联系。尽管最近取得了进展，但对人类蛋白质复合物组成的了解仍然有限。为了缩小这一差距，我们应用了一种综合的全球蛋白质组学分析方法，该方法基于培养的人类细胞提取物的色谱分离成1000多个生化部分，随后通过定量串联质谱分析，系统地识别了3,006种稳定相关的可溶性人类蛋白质之间的13,993个高可信度物理相互作用网络。我们报道的622个假定的蛋白质复合物中的大多数与核心生物学过程有关，并且包含候选疾病基因和非纳米化蛋白质，以了解其机制。引人注目的是，尽管更大的多蛋白组合往往被更广泛地注释和进化保守，但具有5个或更少亚基的人类蛋白质复合物更有可能在功能上未被注释或仅限于脊椎动物，这表明更近期的功能创新。
Cellular processes often depend on stable physical associations between proteins. Despite recent progress, knowledge of the composition of human protein complexes remains limited. To close this gap, we applied an integrative global proteomic profiling approach, based on chromatographic separation of cultured human cell extracts into more than one thousand biochemical fractions which were subsequently analyzed by quantitative tandem mass spectrometry, to systematically identify a network of 13,993 high-confidence physical interactions among 3,006 stably-associated soluble human proteins. Most of the 622 putative protein complexes we report are linked to core biological processes, and encompass both candidate disease genes and unnanotated proteins to inform on mechanism. Strikingly, whereas larger multi-protein assemblies tend to be more extensively annotated and evolutionarily conserved, human protein complexes with 5 or fewer subunits are far more likely to be functionally un-annotated or restricted to vertebrates, suggesting more recent functional innovations.
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影响因子：
64.8
作者：
Gavin, AC;Bösche, M;Superti-Furga, G
通讯作者：
Superti-Furga, G
影响因子：
4.4
作者：
Eng, Jimmy K.;Fischer, Bernd;MacCoss, Michael J.
通讯作者：
MacCoss, Michael J.
DOI：
10.1016/j.jchromb.2006.10.075
发表时间：
2007-02-15
影响因子：
3
作者：
Havugimana, Pierre C.;Wong, Peter;Emili, Andrew
通讯作者：
Emili, Andrew
影响因子：
64.8
作者：
Gavin, AC;Aloy, P;Superti-Furga, G
通讯作者：
Superti-Furga, G
DOI：
10.1074/mcp.m111.014050
发表时间：
2012-03
期刊：
Molecular & cellular proteomics : MCP
影响因子：
--
作者：
Geiger T;Wehner A;Schaab C;Cox J;Mann M
通讯作者：
Mann M