Molecular topography of an entire nervous system.
Molecular topography of an entire nervous system.
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DOI：
10.1016/j.cell.2021.06.023
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发表时间：
2021-08-05
期刊：
影响因子：
64.5
通讯作者：
Miller DM 3rd
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Taylor SR;Santpere G;Weinreb A;Barrett A;Reilly MB;Xu C;Varol E;Oikonomou P;Glenwinkel L;McWhirter R;Poff A;Basavaraju M;Rafi I;Yemini E;Cook SJ;Abrams A;Vidal B;Cros C;Tavazoie S;Sestan N;Hammarlund M;Hobert O;Miller DM 3rd
我们已经制作了秀丽隐杆线虫神经系统所有302个神经元的表达谱，这些神经元的解剖结构和接线图与单细胞分辨率相匹配。我们的研究结果表明，单个神经元类别可以通过特定基因家族的组合表达来单独鉴定。例如，每个神经元类表达约23个神经肽基因和约36个神经肽受体的不同编码，描绘了一个复杂而广阔的“无线”信号网络。为了证明这个综合基因表达目录的实用性，我们使用计算方法(1)确定神经元特异性基因表达的顺式调控元件(2)揭示在过程放置和突触特异性中具有潜在作用的粘附蛋白。我们的表情数据可以在cengen.org上找到，也可以在web应用程序CengenApp上查询。我们期望这种神经元特异性的基因表达目录将促进对线虫神经系统中定义解剖学、连通性和功能的潜在机制的研究。一个基因表达图谱捕获了成熟秀丽隐杆线虫中所有302个神经元，揭示了细胞异质性、连通性和功能的分子基础。
We have produced expression profiles of all 302 neurons of the C. elegans nervous system that match the single cell resolution of its anatomy and wiring diagram. Our results suggest that individual neuron classes can be solely identified by combinatorial expression of specific gene families. For example, each neuron class expresses distinct codes of ~23 neuropeptide genes and ~36 neuropeptide receptors, delineating a complex and expansive “wireless” signaling network. To demonstrate the utility of this comprehensive gene expression catalog, we used computational approaches to (1) identify cis-regulatory elements for neuron-specific gene expression and (2) reveal adhesion proteins with potential roles in process placement and synaptic specificity. Our expression data are available at cengen.org and can be interrogated at the web application CengenApp. We expect that this neuron-specific directory of gene expression will spur investigations of underlying mechanisms that define anatomy, connectivity and function throughout the C. elegans nervous system. A gene expression map captures all 302 neurons in mature C. elegans deciphering the molecular basis for cell heterogeneity, connectivity and function.
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影响因子：
64.8
作者：
Cao, Junyue;Spielmann, Malte;Shendure, Jay
通讯作者：
Shendure, Jay
影响因子：
46.9
作者：
Becht, Etienne;McInnes, Leland;Newell, Evan W.
通讯作者：
Newell, Evan W.
影响因子：
64.5
作者：
Davie K;Janssens J;Koldere D;De Waegeneer M;Pech U;Kreft Ł;Aibar S;Makhzami S;Christiaens V;Bravo González-Blas C;Poovathingal S;Hulselmans G;Spanier KI;Moerman T;Vanspauwen B;Geurs S;Voet T;Lammertyn J;Thienpont B;Liu S;Konstantinides N;Fiers M;Verstreken P;Aerts S
通讯作者：
Aerts S
影响因子：
4.3
作者：
Baruch, Leehod;Itzkovitz, Shalev;Segal, Eran
通讯作者：
Segal, Eran
影响因子：
56.9
作者：
Cao, Junyue;Packer, Jonathan S.;Shendure, Jay
通讯作者：
Shendure, Jay