A lysozyme with altered substrate specificity facilitates prey cell exit by the periplasmic predator Bdellovibrio bacteriovorus.
A lysozyme with altered substrate specificity facilitates prey cell exit by the periplasmic predator Bdellovibrio bacteriovorus.
复制标题
DOI：
10.1038/s41467-020-18139-8
复制
发表时间：
2020-09-23
影响因子：
16.6
通讯作者：
Lovering AL
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Harding CJ;Huwiler SG;Somers H;Lambert C;Ray LJ;Till R;Taylor G;Moynihan PJ;Sockett RE;Lovering AL
溶菌酶是最具特征的酶之一，作用于细胞壁底物肽聚糖。在这里，检查入侵的细菌周质捕食蛭弧菌噬菌，我们报告了一种多样化的溶菌酶，DslA，它的行为，不寻常的，（GlcNAc-）脱乙酰肽聚糖。B。已知噬菌菌能使被捕食细菌的肽聚糖脱乙酰化，在被捕食细菌和自身壁之间产生重要的化学差异，并意味着使用推定的脱乙酰特异性“退出酶”。DslA执行此作用，并且ΔDslA菌株表现出离开猎物的延迟。DslA的结构揭示了一种修饰的溶菌酶超家族折叠，具有几种适应性。生物化学测定证实了DslA对脱乙酰化细胞壁的特异性，以及两个谷氨酸残基用于催化的用途。离体添加的外源性DslA能够过早地释放B。食菌动物从猎物中分离出来，在捕食生命周期的中途。我们定义了一个机制的特异性，调用空间选择，并使用由此产生的基序，以确定更广泛的DslA同系物。细菌周质捕食者噬菌蛭弧菌（Bdellovibrio bacteriovorus）在入侵早期将猎物细菌的肽聚糖脱乙酰化。在这里，作者确定和表征蛭弧菌溶菌酶，特异性地作用于脱乙酰肽聚糖，是重要的周质出口。
Lysozymes are among the best-characterized enzymes, acting upon the cell wall substrate peptidoglycan. Here, examining the invasive bacterial periplasmic predator Bdellovibrio bacteriovorus, we report a diversified lysozyme, DslA, which acts, unusually, upon (GlcNAc-) deacetylated peptidoglycan. B. bacteriovorus are known to deacetylate the peptidoglycan of the prey bacterium, generating an important chemical difference between prey and self walls and implying usage of a putative deacetyl-specific “exit enzyme”. DslA performs this role, and ΔDslA strains exhibit a delay in leaving from prey. The structure of DslA reveals a modified lysozyme superfamily fold, with several adaptations. Biochemical assays confirm DslA specificity for deacetylated cell wall, and usage of two glutamate residues for catalysis. Exogenous DslA, added ex vivo, is able to prematurely liberate B. bacteriovorus from prey, part-way through the predatory lifecycle. We define a mechanism for specificity that invokes steric selection, and use the resultant motif to identify wider DslA homologues. The bacterial periplasmic predator Bdellovibrio bacteriovorus deacetylates the peptidoglycan of the prey bacterium early upon invasion. Here, the authors identify and characterize a Bdellovibrio lysozyme that acts specifically on deacetylated peptidoglycan and is important for periplasmic exit.
登录
查看更多内容
影响因子：
4.6
作者：
Lambert C;Lerner TR;Bui NK;Somers H;Aizawa S;Liddell S;Clark A;Vollmer W;Lovering AL;Sockett RE
通讯作者：
Sockett RE
DOI：
10.1002/anie.201206749
发表时间：
2012-12-07
期刊：
Angewandte Chemie (International ed. in English)
影响因子：
--
作者：
Kuru E;Hughes HV;Brown PJ;Hall E;Tekkam S;Cava F;de Pedro MA;Brun YV;VanNieuwenhze MS
通讯作者：
VanNieuwenhze MS
影响因子：
5.8
作者：
Joosten, Robbie P.;Joosten, Krista;Perrakis, Anastassis
通讯作者：
Perrakis, Anastassis
DOI：
10.1107/s0907444904019158
发表时间：
2004-12-01
影响因子：
2.2
作者：
Emsley, P;Cowtan, K
通讯作者：
Cowtan, K
DOI：
10.1038/nsb0296-133
发表时间：
1996-02-01
期刊：
NATURE STRUCTURAL BIOLOGY
影响因子：
--
作者：
Monzingo, AF;Marcotte, EM;Robertus, JD
通讯作者：
Robertus, JD