R-loop and its functions at the regulatory interfaces between transcription and (epi)genome.
R-loop and its functions at the regulatory interfaces between transcription and (epi)genome.
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DOI：
10.1016/j.bbagrm.2021.194750
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发表时间：
2021-11
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Wang GG
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kim A;Wang GG
R-loop是一种普遍存在的特殊染色质结构，在广泛的生物过程中起着关键作用。特别是，通常由于RNA聚合酶暂停或RNA生物发生功能障碍而产生的共转录r环，可以启动分子事件，以上下文依赖的方式调节局部基因转录并与染色质修饰进行串扰。r环的细胞“读者”被确定，对r环的内稳态和基因调控产生重要影响。越来越多的证据也表明，在人类病理过程中，尤其是癌症和神经系统疾病中，r环放松管制是一个频繁的、有时是初始的事件。这篇综述的目的是涵盖最近在理解r环生物学基础方面的进展，这些进展开始揭示r环与各种生物过程中涉及的因素的复杂相互作用，如转录、RNA加工和表转录组修饰（如n6 -甲基腺苷）、DNA损伤感知和修复以及表观遗传调控。
R-loop represents a prevalent and specialized chromatin structure critically involved in a wide range of biological processes. In particular, co-transcriptional R-loops, produced often due to RNA polymerase pausing or RNA biogenesis malfunction, can initiate molecular events to context-dependently regulate local gene transcription and crosstalk with chromatin modifications. Cellular “readers” of R-loops are identified, exerting crucial impacts on R-loop homeostasis and gene regulation. Mounting evidence also supports R-loop deregulation as a frequent, sometimes initiating, event during human pathologies, notably cancer and neurological disorder. The purpose of this review is to cover recent advances in understanding the fundamentals of R-loop biology, which start to unveil complex interplays of R-loops with factors involved in various biological processes such as transcription, RNA processing and epitranscriptomic modification (such as N6-methyladenosine), DNA damage sensing and repair, and epigenetic regulation.
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DOI：
10.1016/j.tig.2016.10.002
发表时间：
2016-12
期刊：
Trends in genetics : TIG
影响因子：
--
作者：
Chédin F
通讯作者：
Chédin F
DOI：
10.1083/jcb.202101092
发表时间：
2021-09-06
期刊：
The Journal of cell biology
影响因子：
--
作者：
Crossley MP;Brickner JR;Song C;Zar SMT;Maw SS;Chédin F;Tsai MS;Cimprich KA
通讯作者：
Cimprich KA
水稻 R 环与基因转录和表观遗传修饰功能关系的表征
影响因子：
7
作者：
Fang, Yuan;Chen, Lifen;Zhang, Wenli
通讯作者：
Zhang, Wenli
影响因子：
14.9
作者：
Crossley MP;Bocek MJ;Hamperl S;Swigut T;Cimprich KA
通讯作者：
Cimprich KA
影响因子：
16.6
作者：
Cohen S;Puget N;Lin YL;Clouaire T;Aguirrebengoa M;Rocher V;Pasero P;Canitrot Y;Legube G
通讯作者：
Legube G