Automated tuberculosis diagnosis using fluorescence images from a mobile microscope.
Automated tuberculosis diagnosis using fluorescence images from a mobile microscope.
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DOI：
10.1007/978-3-642-33454-2_43
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发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Malik, Jitendra
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Chang, Jeannette;Arbelaez, Pablo;Switz, Neil;Reber, Clay;Tapley, Asa;Davis, J. Lucian;Cattamanchi, Adithya;Fletcher, Daniel;Malik, Jitendra
在资源匮乏的地区，最常见的结核病诊断方法是在痰涂片的显微图像中目测鉴定杆状结核杆菌。我们提出了一种使用数字显微镜(如CellScope)的图像来自动检测结核病的算法，CellScope是一种新型的便携式设备，可以用于光明和荧光显微镜。这类平台上的自动化处理可以通过将医疗保健带到获得实验室诊断机会有限的农村地区来拯救生命。该算法采用形态运算和高斯核模板匹配相结合的方法识别候选TB目标。我们使用Hu矩、几何和光度特征以及方向梯度直方图来表征这些目标，然后进行支持向量机分类。我们在乌干达诊所收集的一大组CellScope图像(对应于290名患者的594张图像)上测试了我们的算法。我们的对象级分类性能很高，平均准确率为89.2%±2.1%。对于幻灯片级别的分类，我们的算法在人类读者级别上执行，展示了对全球医疗保健产生重大影响的潜力。
In low-resource areas, the most common method of tuberculosis (TB) diagnosis is visual identification of rod-shaped TB bacilli in microscopic images of sputum smears. We present an algorithm for automated TB detection using images from digital microscopes such as CellScope, a novel, portable device capable of brightfield and fluorescence microscopy. Automated processing on such platforms could save lives by bringing healthcare to rural areas with limited access to laboratory-based diagnostics. Our algorithm applies morphological operations and template matching with a Gaussian kernel to identify candidate TB-objects. We characterize these objects using Hu moments, geometric and photometric features, and histograms of oriented gradients and then perform support vector machine classification. We test our algorithm on a large set of CellScope images (594 images corresponding to 290 patients) from sputum smears collected at clinics in Uganda. Our object-level classification performance is highly accurate, with Average Precision of 89.2% ± 2.1%. For slide-level classification, our algorithm performs at the level of human readers, demonstrating the potential for making a significant impact on global healthcare.
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影响因子：
2
作者：
Forero, M. G.;Cristobal, G.;Desco, M.
通讯作者：
Desco, M.
DOI：
10.1109/tit.1962.1057692
发表时间：
1962-01-01
期刊：
IRE TRANSACTIONS ON INFORMATION THEORY
影响因子：
--
作者：
HU, M
通讯作者：
HU, M
DOI：
10.1109/titb.2009.2028339
发表时间：
2010-07
期刊：
IEEE transactions on information technology in biomedicine : a publication of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society
影响因子：
--
作者：
Khutlang R;Krishnan S;Dendere R;Whitelaw A;Veropoulos K;Learmonth G;Douglas TS
通讯作者：
Douglas TS
影响因子：
7.5
作者：
CORTES, C;VAPNIK, V
通讯作者：
VAPNIK, V
基于手机的临床显微镜用于全球健康应用。
影响因子：
3.7
作者：
Breslauer, David N.;Maamari, Robi N.;Switz, Neil A.;Lam, Wilbur A.;Fletcher, Daniel A.
通讯作者：
Fletcher, Daniel A.