Cryo-Electron Microscopy of the Translational Apparatus: Experimental Evidence for the Paths of mRNA, tRNA, and the Polypeptide Chain
Cryo-Electron Microscopy of the Translational Apparatus: Experimental Evidence for the Paths of mRNA, tRNA, and the Polypeptide Chain
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翻译装置的冷冻电子显微镜：mRNA、tRNA 和多肽链路径的实验证据
DOI：
--
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发表时间：
2000
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
R. Agrawal
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
J. Frank;R. Grassucci;A. Heagle;C. Spahn;P. Penczek;R. Agrawal
蛋白质合成是一个将两个相当长的线性结构（mRNA和新生多肽链）和大的蛋白质因子（EF-G和氨酰-tRNA链EF-Tu GTP三元复合物）紧密结合在一起的过程，蛋白质合成提出了一个交通控制的逻辑问题：如何保证不间断的高精度性能，而没有空间干扰和各种配体的纠缠。由于冷冻电子显微镜（cryo-EM）可视化提供了第一个详细的三维（3-D）图像的核糖体，大量的工作已经进入映射的tRNA和延伸因子结合到核糖体在延长周期的各个阶段。最近的一项研究发现，70 S核糖体携带一个基因插入的tRNA样RNA片段，提供了一个更高分辨率（17-A）的空核糖体图谱，在减法中使用这个新图谱产生了一个线性质量分布，覆盖了mRNA路径的平台侧片段，以及一个质量徘徊在30 S亚基通道的入口处。结合到核糖体的tRNA已经通过3-D cryo-EM在各种tRNA-核糖体复合物中直接可视化。核糖体结合的tRNA的可视化仍然是一项具有挑战性的任务，因为分子的最小尺寸是cryo-EM分辨率的量级，并且一些tRNA结合状态的占用率本质上是低的。
As a process that brings together, in close proximity, two linear structures of considerable length (mRNA and the nascent polypeptide chain) and large protein factors (EF-G and aminoacyl-tRNA·EF-Tu·GTP ternary complex), protein synthesis poses a logistic problem of traffic control: how to guarantee uninterrupted, high-precision performance without steric interference and entanglement of the various ligands. Since cryo-electron microscopy (cryo-EM) visualization provided the first detailed three-dimensional (3-D) images of the ribosome, much work has gone into the mapping of tRNA and elongation factors bound to the ribosome at various stages of the elongation cycle. A recent study of a 70S ribosome carrying a genetically inserted tRNA-like RNA fragment furnished a higher-resolution (17-A) map of the vacant ribosome, and the use of this new map in the subtraction produced a linear mass distribution covering the platform side segment of the mRNA path, as well as a mass hovering just at the entrance of the 30S subunit channel. tRNA bound to the ribosome has been directly visualized by 3-D cryo-EM in various tRNA-ribosome complexes. Visualization of the ribosome-bound tRNA is still a challenging task because the smallest dimension of the molecule is on the order of the resolution of cryo-EM and the occupancy of some tRNA binding states is intrinsically low.
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核糖体的三维冷冻电子显微镜。
影响因子：
--
作者：
Frank,J;Penczek,P;Agrawal,RK;Grassucci,RA;Heagle,AB
通讯作者：
Heagle,AB
功能普遍性和进化多样性：来自核糖体结构的见解。
DOI：
10.1016/s0969-2126(98)00069-0
发表时间：
1998
期刊：
Structure (London, England : 1993)
影响因子：
--
作者：
Yonath,A;Franceschi,F
通讯作者：
Franceschi,F
通过基因标记和冷冻电子显微镜对核糖体内的 RNA 螺旋进行直接三维定位和阳性鉴定。
DOI：
10.1016/s0969-2126(00)88347-1
发表时间：
1999
期刊：
Structure (London, England : 1993)
影响因子：
--
作者：
Spahn,CM;Grassucci,RA;Penczek,P;Frank,J
通讯作者：
Frank,J
影响因子：
56.9
作者：
Beckmann, R;Bubeck, D;Frank, J
通讯作者：
Frank, J
DOI：
10.1073/pnas.95.11.6134
发表时间：
1998-05-26
影响因子：
11.1
作者：
Agrawal, RK;Penczek, P;Frank, J
通讯作者：
Frank, J