Orthogonal Enzyme-Substrate Design Strategy for Discovery of Human Protein Palmitoyltransferase Substrates.
Orthogonal Enzyme-Substrate Design Strategy for Discovery of Human Protein Palmitoyltransferase Substrates.
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DOI：
10.1021/jacs.3c04359
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发表时间：
2023-10-18
影响因子：
15
通讯作者：
Banerjee, Anirban
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Puthenveetil, Robbins;Auger, Shelby A.;Gomez-Navarro, Natalia;Rana, Mitra Shumsher;Das, Riki;Healy, Liam Brendan;Suazo, Kiall F.;Shi, Zhen-Dan;Swenson, Rolf E.;Distefano, Mark D.;Banerjee, Anirban
蛋白质棕榈酰化是最普遍的蛋白质脂化形式，有5000多种底物。棕榈酰化蛋白几乎参与了细胞生理学的所有领域，并与几种人类疾病有关。23个zDHHC酶催化蛋白质棕榈酰化，并在每个zDHHC成员的底物之间广泛重叠。目前，还没有全球性的策略来描述单个zDHHC酶的生理底物而不干扰自然细胞池。在这里，我们概述了一个通用的方法来实现这一点，在合成的正交底物的基础上，只与工程的zDHHC酶兼容。我们通过验证已知的底物来证明这一策略的实用性，并使用它来鉴定两种人zDHHC酶的新底物。最后，我们利用这种方法发现和探索了一系列宿主限制因子对包括SARS-CoV-2在内的致病病毒的保守棕榈酰化作用。
Protein palmitoylation, with more than 5000 substrates, is the most prevalent form of protein lipidation. Palmitoylated proteins participate in almost all areas of cellular physiology and have been linked to several human diseases. Twenty-three zDHHC enzymes catalyze protein palmitoylation with extensive overlap among the substrates of each zDHHC member. Currently, there is no global strategy to delineate the physiological substrates of individual zDHHC enzymes without perturbing the natural cellular pool. Here, we outline a general approach to accomplish this on the basis of synthetic orthogonal substrates that are only compatible with engineered zDHHC enzymes. We demonstrate the utility of this strategy by validating known substrates and use it to identify novel substrates of two human zDHHC enzymes. Finally, we employ this method to discover and explore conserved palmitoylation in a family of host restriction factors against pathogenic viruses, including SARS-CoV-2.
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影响因子：
2.9
作者：
Hamel LD;Deschenes RJ;Mitchell DA
通讯作者：
Mitchell DA
DOI：
10.1126/science.aao6326
发表时间：
2018-01-12
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Rana MS;Kumar P;Lee CJ;Verardi R;Rajashankar KR;Banerjee A
通讯作者：
Banerjee A
影响因子：
15
作者：
Lin, Q;Jiang, FY;Gray, NS
通讯作者：
Gray, NS
DOI：
10.1007/978-1-4939-9532-5_16
发表时间：
2019-01-01
期刊：
PROTEIN LIPIDATION: METHODS AND PROTOCOLS
影响因子：
--
作者：
Blanc, Mathieu;David, Fabrice P. A.;van der Goot, F. Gisou
通讯作者：
van der Goot, F. Gisou
影响因子：
4.8
作者：
Lobo, S;Greentree, WK;Deschenes, RJ
通讯作者：
Deschenes, RJ