FQC Dashboard: integrates FastQC results into a web-based, interactive, and extensible FASTQ quality control tool.
FQC Dashboard: integrates FastQC results into a web-based, interactive, and extensible FASTQ quality control tool.
复制标题
DOI：
10.1093/bioinformatics/btx373
复制
发表时间：
2017-10-01
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
McCue LA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Brown J;Pirrung M;McCue LA
FQC 软件通过使用 FastQC 执行 QC 协议、解析结果并将质量指标聚合到交互式仪表板中来促进 FASTQ 文件的质量控制，该交互式仪表板旨在丰富地总结各个测序运行。仪表板将样本分组到下拉列表中，以便在数据集之间导航，利用人类可读的配置文件来操作页面和选项卡，并且可以使用 CSV 数据进行扩展。 FQC 用 Python 3 和 Javascript 实现，并在 MIT 许可证下维护。文档和源代码位于：https://github.com/pnnl/fqc。
FQC is software that facilitates quality control of FASTQ files by carrying out a QC protocol using FastQC, parsing results, and aggregating quality metrics into an interactive dashboard designed to richly summarize individual sequencing runs. The dashboard groups samples in dropdowns for navigation among the data sets, utilizes human-readable configuration files to manipulate the pages and tabs, and is extensible with CSV data. FQC is implemented in Python 3 and Javascript, and is maintained under an MIT license. Documentation and source code is available at: https://github.com/pnnl/fqc.
DOI：
10.1093/bioinformatics/btw354
发表时间：
2016-10-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Ewels P;Magnusson M;Lundin S;Käller M
通讯作者：
Käller M