Sexual difference of small RNA expression in Tetralogy of Fallot.
Sexual difference of small RNA expression in Tetralogy of Fallot.
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法洛四联症小RNA表达的性别差异
DOI：
10.1038/s41598-018-31243-6
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发表时间：
2018-08-27
影响因子：
4.6
通讯作者：
Fu Q
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Wang B;Shi G;Zhu Z;Chen H;Fu Q
小分子RNA，特别是microRNA，在心脏发育和先天性心脏病中发挥着重要作用。几项研究表明，在法洛四联症（TOF）患者的心室组织中存在失调的miRNA。在本研究中，我们进行了高通量测序，以获得来自10名年龄匹配的TOF患者的心脏右心室样本中小RNA转录组的总体概况。这些样品显示了miRNA和线粒体相关RNA的优势组成。通过sRNA聚类分析和差异基因表达分析，发现TOF患者sRNA表达存在明显的性别差异。miR-1/miR-133被认为是心脏发育所必需的，是TOF心脏中sRNA表达在性别间差异最大的原因。
Small RNAs, especially the microRNAs, have been revealed to play great roles in heart development and congenital heart defects. Several studies have shown dysregulated miRNAs in ventricular tissues of Tetralogy of Fallot (TOF) patients. In the present study, we conducted high throughput sequencing to obtain the global profiling of small RNA transcriptome in heart right ventricular samples from 10 age -matched TOF patients. These samples showed dominant composition of miRNA and mitochondrial associated RNAs. By sRNA cluster identification and differential gene expression analysis, significant sexual difference was discovered for sRNA expression in TOF patients. miR-1/miR-133, which have been identified as essential for cardiac development, account for the most variance of sRNA expression between sexes in TOF hearts.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btq033
发表时间：
2010-03-15
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Quinlan AR;Hall IM
通讯作者：
Hall IM
影响因子：
1.7
作者：
Jurka, J;Kapitonov, VV;Walichiewicz, J
通讯作者：
Walichiewicz, J
影响因子：
3
作者：
Stauffer BL;Sobus RD;Sucharov CC
通讯作者：
Sucharov CC
影响因子：
5.8
作者：
Li, Heng
通讯作者：
Li, Heng
影响因子：
5.8
作者：
Pantano, Lorena;Estivill, Xavier;Marti, Eulalia
通讯作者：
Marti, Eulalia