Transcription suppression is mediated by the HDAC1-Sin3 complex in Xenopus nucleoplasmic extract.
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DOI：
10.1016/j.jbc.2022.102578
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发表时间：
2022-11
影响因子：
4.8
通讯作者：
Long, David T.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Quaas, Colleen E.;Lin, Baicheng;Long, David T.
组蛋白的修饰提供了调节染色质结构和DNA进入的动态机制。特别是组蛋白乙酰化在控制DNA、组蛋白和其他染色质相关蛋白之间的相互作用中起着重要作用。组蛋白乙酰化模式的缺陷会干扰正常的基因表达，并成为多种人类疾病的基础。在这里，我们利用非洲爪蟾卵提取物来研究组蛋白乙酰化的变化如何影响一个定义的基因结构的转录。我们发现，组蛋白去乙酰化酶1和2（HDAC 1/2）的抑制，特别是抵消转录抑制，防止染色质压实和组蛋白残基H4 K5和H4 K8的去乙酰化。这些位点的乙酰化支持染色质阅读器和转录调节因子BRD 4的结合。我们还确定HDAC 1作为转录抑制的主要驱动因素，并表明这种活性是通过Sin 3组蛋白脱乙酰酶复合物介导的。这些发现突出了HDAC 1和HDAC 2之间的功能差异，这些差异通常被认为是功能冗余的，并为其活性提供了额外的分子背景。
Modification of histones provides a dynamic mechanism to regulate chromatin structure and access to DNA. Histone acetylation, in particular, plays a prominent role in controlling the interaction between DNA, histones, and other chromatin-associated proteins. Defects in histone acetylation patterns interfere with normal gene expression and underlie a wide range of human diseases. Here, we utilize Xenopus egg extracts to investigate how changes in histone acetylation influence transcription of a defined gene construct. We show that inhibition of histone deacetylase 1 and 2 (HDAC1/2) specifically counteracts transcription suppression by preventing chromatin compaction and deacetylation of histone residues H4K5 and H4K8. Acetylation of these sites supports binding of the chromatin reader and transcription regulator BRD4. We also identify HDAC1 as the primary driver of transcription suppression and show that this activity is mediated through the Sin3 histone deacetylase complex. These findings highlight functional differences between HDAC1 and HDAC2, which are often considered to be functionally redundant, and provide additional molecular context for their activity.
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DOI：
10.1126/science.1249830
发表时间：
2014-10-31
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Baud MGJ;Lin-Shiao E;Cardote T;Tallant C;Pschibul A;Chan KH;Zengerle M;Garcia JR;Kwan TT;Ferguson FM;Ciulli A
通讯作者：
Ciulli A
DOI：
10.1016/j.bbagrm.2009.05.007
发表时间：
2009-06
期刊：
Biochimica et biophysica acta
影响因子：
--
作者：
Grzenda A;Lomberk G;Zhang JS;Urrutia R
通讯作者：
Urrutia R
影响因子：
4.6
作者：
Drogaris P;Villeneuve V;Pomiès C;Lee EH;Bourdeau V;Bonneil E;Ferbeyre G;Verreault A;Thibault P
通讯作者：
Thibault P
影响因子：
4.6
作者：
Gonneaud, Alexis;Turgeon, Naomie;Asselin, Claude
通讯作者：
Asselin, Claude
影响因子：
10.5
作者：
Dewar JM;Low E;Mann M;Räschle M;Walter JC
通讯作者：
Walter JC