A high-resolution spatiotemporal atlas of gene expression of the developing mouse brain.
A high-resolution spatiotemporal atlas of gene expression of the developing mouse brain.
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DOI：
10.1016/j.neuron.2014.05.033
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发表时间：
2014-07-16
期刊：
影响因子：
16.2
通讯作者：
Jones AR
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Thompson CL;Ng L;Menon V;Martinez S;Lee CK;Glattfelder K;Sunkin SM;Henry A;Lau C;Dang C;Garcia-Lopez R;Martinez-Ferre A;Pombero A;Rubenstein JLR;Wakeman WB;Hohmann J;Dee N;Sodt AJ;Young R;Smith K;Nguyen TN;Kidney J;Kuan L;Jeromin A;Kaykas A;Miller J;Page D;Orta G;Bernard A;Riley Z;Smith S;Wohnoutka P;Hawrylycz MJ;Puelles L;Jones AR
为了为大脑发育的基因结构提供一个时间框架，我们对胚胎和出生后小鼠大脑7个发育阶段的约2100个基因进行了原位杂交，并通过自动化信息学管道进行了处理，并进行了人工注释。该资源包括434,946张图像，7个参考地图集，一个个体发生本体，以及探索神经发育过程中基因共表达的工具。发现了与发育现象相吻合的基因组。在E11.5和E13.5时，检测到控制大脑分子组织的原则的时间转移，出现了短暂的神经细胞，基于板的大脑组织。最后，这些数据提供了区分大脑结构和识别组织发育年龄的转录因子代码，为最终的遗传操作或跟踪特定大脑结构的发育提供了基础。该资源可作为艾伦发育中的小鼠大脑图谱（developingmouse.brain-map.org）获得。
To provide a temporal framework for the genoarchitecture of brain development, in situ hybridization data were generated for embryonic and postnatal mouse brain at 7 developmental stages for ~2100 genes, processed with an automated informatics pipeline and manually annotated. This resource comprises 434,946 images, 7 reference atlases, an ontogenetic ontology, and tools to explore co-expression of genes across neurodevelopment. Gene sets coinciding with developmental phenomena were identified. A temporal shift in the principles governing the molecular organization of the brain was detected, with transient neuromeric, plate-based organization of the brain present at E11.5 and E13.5. Finally, these data provided a transcription factor code that discriminates brain structures and identifies the developmental age of a tissue, providing a foundation for eventual genetic manipulation or tracking of specific brain structures over development. The resource is available as the Allen Developing Mouse Brain Atlas (developingmouse.brain-map.org).
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