The complete mitochondrial genome of Pseudocolochirus violaceus (Cucumariidae, Dendrochirotida).
The complete mitochondrial genome of Pseudocolochirus violaceus (Cucumariidae, Dendrochirotida).
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Pseudocolochirus violaceus（Cucumariidae，Dendrochirotida）的完整线粒体基因组
DOI：
10.1080/23802359.2020.1788455
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发表时间：
2020-07-14
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Zhao J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Wang Y;Zeng L;Wen J;Li X;Huang Y;Sun Y;Zhao J
本研究获得并描述了紫伪翼手参（Pseudocolochirus violaceus）的完整线粒体基因组。该完整线粒体基因组长度为15752bp，包含13个蛋白质编码基因、2个核糖体RNA基因和22个转运RNA基因。除了ND6和5个tRNAs外，其他基因均由重链编码。重链的总体碱基组成是A占38.65%、G占12.09%、C占24.31%、T占24.95%，A + T含量较高，为63.6%。系统发育分析表明，紫伪翼手参与加州拟刺参（Cucumaria miniata）亲缘关系最近。新描述的线粒体基因组可能为海参纲（Holothuroidea）的系统发育分析提供有价值的数据。
The complete mitochondrial genome ofPseudocolochirus violaceuswas obtained and described in this study. This complete mitochondrial genome is 15,752 bp in length and consists of 13 protein-coding genes, 2 ribosomal RNA genes, and 22 transfer RNA genes. Except ND6 and 5 tRNAs, the others were encoded by the heavy strand. The overall base composition of the heavy-strand was 38.65% A, 12.09% G, 24.31% C, and 24.95% T, with a high A + T content of 63.6%. The phylogenetic analysis suggested thatP. violaceuswas closest toCucumaria miniata. The newly described mitochondrial genome may provide valuable data for phylogenetic analysis for Holothuroidea.
影响因子：
14.9
作者：
Lowe TM;Chan PP
通讯作者：
Chan PP
影响因子：
1.7
作者：
Bankevich, Anton;Nurk, Sergey;Pevzner, Pavel A.
通讯作者：
Pevzner, Pavel A.
影响因子：
0.6
作者：
Dolmatov, I. Yu.;Nguyen An Khang;Kamenev, Ya. O.
通讯作者：
Kamenev, Ya. O.