Quantifying E. coli proteome and transcriptome with single-molecule sensitivity in single cells.
Quantifying E. coli proteome and transcriptome with single-molecule sensitivity in single cells.
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DOI：
10.1126/science.1188308
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发表时间：
2010-07-30
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Xie XS
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Taniguchi Y;Choi PJ;Li GW;Chen H;Babu M;Hearn J;Emili A;Xie XS
蛋白质和mRNA拷贝数在等生细菌种群中因细胞而异。但是，这些分子通常以低拷贝数存在，并且在单个细胞中很难检测到。在这里，我们使用新构建的黄色荧光蛋白融合库对大肠杆菌进行单分子敏感性的单个细胞中蛋白质和mRNA表达的定量分析。我们发现，几乎所有蛋白质的分布都可以通过伽马分布来描述，两个拟合参数在低表达水平下，将物理解释清晰地解释为转录速率和蛋白质爆发大小。在高表达水平下，分布由外部噪声支配。令人惊讶的是，我们发现任何给定基因的单个细胞的蛋白质和mRNA拷贝数都是不相关的。
Protein and mRNA copy numbers vary from cell to cell in isogenic bacterial populations. However, these molecules often exist in low copy numbers, and are difficult to detect in single cells. Here we carried out quantitative system-wide analyses of protein and mRNA expression in individual cells with single-molecule sensitivity using a newly constructed yellow fluorescent protein fusion library for Escherichia coli. We found that almost all protein number distributions can be described by the gamma distribution with two fitting parameters which, at low expression levels, have clear physical interpretations as the transcription rate and protein burst size. At high expression levels, the distributions are dominated by extrinsic noise. Strikingly, we found that a single cell's protein and mRNA copy numbers for any given gene are uncorrelated.
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影响因子：
56.9
作者：
Maamar, Hedia;Raj, Arjun;Dubnau, David
通讯作者：
Dubnau, David
影响因子：
48
作者：
Butland, Gareth;Babu, Mohan;Emili, Andrew
通讯作者：
Emili, Andrew
DOI：
10.1073/pnas.43.7.553
发表时间：
1957-01-01
影响因子：
11.1
作者：
NOVICK, A;WEINER, M
通讯作者：
WEINER, M
DOI：
10.1073/pnas.162041399
发表时间：
2002-10-01
影响因子：
11.1
作者：
Swain, PS;Elowitz, MB;Siggia, ED
通讯作者：
Siggia, ED
影响因子：
56.9
作者：
Femino, A;Fay, FS;Singer, RH
通讯作者：
Singer, RH