Analysis of Viral Spike Protein N-Glycosylation Using Ultraviolet Photodissociation Mass Spectrometry.
Analysis of Viral Spike Protein N-Glycosylation Using Ultraviolet Photodissociation Mass Spectrometry.
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DOI：
10.1021/acs.analchem.1c04874
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发表时间：
2022-04-19
影响因子：
7.4
通讯作者：
Brodbelt, Jennifer S.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Escobar, Edwin E.;Wang, Shuaishuai;Goswami, Rupanjan;Lanzillotti, Michael B.;Li, Lei;McLellan, Jason S.;Brodbelt, Jennifer S.
由于与蛋白质结合的寡糖的多样性、单糖连接模式的变化以及聚糖和蛋白质之间连接的不稳定性，通过串联质谱法表征蛋白质糖基化仍然具有挑战性。在这里，我们采用了 HCD 触发的紫外线光解 (UVPD) 方法，用于同时定位糖位点并全面表征聚糖组成和糖间键，后者是由 UVPD 实现的广泛交叉环裂解提供的。该方法用于基于对来自 SARS-CoV-2 和 HKU1 的重组人冠状病毒刺突蛋白进行蛋白水解消化的糖肽进行分析来研究聚糖组成。 UVPD 揭示了独特的糖间连接信息，并可用于可靠地定位 N-连接糖型。
Characterization of protein glycosylation by tandem mass spectrometry remains challenging owing to the vast diversity of oligosaccharides bound to proteins, the variation in monosaccharide linkage patterns, and the lability of the linkage between the glycan and protein. Here, we have adapted an HCD-triggered-ultraviolet photodissociation (UVPD) approach for the simultaneous localization of glycosites and full characterization of both glycan compositions and intersaccharide linkages, the latter provided by extensive cross-ring cleavages enabled by UVPD. The method is applied to study glycan compositions based on analysis of glycopeptides from proteolytic digestion of recombinant human coronaviruse spike proteins from SARS-CoV-2 and HKU1. UVPD reveals unique intersaccharide linkage information and is leveraged to localize N-linked glycoforms with confidence.
对昆虫和人类细胞中产生的 SARS-CoV-2 刺突蛋白进行位点特异性 O 糖基化分析。
DOI：
10.3390/v13040551
发表时间：
2021-03-25
期刊：
Viruses
影响因子：
--
作者：
Bagdonaite I;Thompson AJ;Wang X;Søgaard M;Fougeroux C;Frank M;Diedrich JK;Yates JR 3rd;Salanti A;Vakhrushev SY;Paulson JC;Wandall HH
通讯作者：
Wandall HH
对HIV聚糖盾的结构和免疫识别。
影响因子：
12.4
作者：
Crispin M;Ward AB;Wilson IA
通讯作者：
Wilson IA