Systematic Detection of Poly(A)+ RNA-Interacting Proteins and Their Differential Binding.
Systematic Detection of Poly(A)+ RNA-Interacting Proteins and Their Differential Binding.
复制标题
Poly(A) RNA 相互作用蛋白及其差异结合的系统检测
DOI：
10.1007/978-1-4939-7213-5_27
复制
发表时间：
2018
影响因子：
--
通讯作者：
Landthaler M.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Milek M;Landthaler M.
RNA结合蛋白是基因表达的动态转录后调节因子。因此，在给定的实验环境中鉴定mRNA结合蛋白是非常重要的。我们描述了一个程序，以丰富的直接聚（A）+RNA蛋白结合剂的4-硫代尿苷增强紫外交联和寡聚（dT）纯化。随后核酸酶介导的RNA结合蛋白（RBP）从mRNA的释放允许通过质谱法检测洗脱的蛋白质。此外，我们提供了一种比较的方法来检测生物刺激后RBP结合活性的差异。
RNA-binding proteins are dynamic posttranscriptional regulators of gene expression. Identification of mRNA-binding proteins in a given experimental setting is thus of great importance. We describe a procedure to enrich for direct poly(A)+RNA protein binders by 4-thiouridine-enhanced UV cross-linking and oligo(dT) purification. Subsequent nuclease-mediated release of RNA-binding proteins (RBPs) from mRNA allows for detection of eluted proteins by mass spectrometry. In addition, we provide a comparative approach to detect differences in RBP binding activity upon a biological stimulus.
DOI：
10.1016/j.ymeth.2016.10.007
发表时间：
2017-04-15
期刊：
Methods (San Diego, Calif.)
影响因子：
--
作者：
Garzia A;Meyer C;Morozov P;Sajek M;Tuschl T
通讯作者：
Tuschl T
用于RNA结合蛋白中RNA结合位点的分配的照片连接和高分辨率质谱法。
影响因子：
48
作者：
Kramer K;Sachsenberg T;Beckmann BM;Qamar S;Boon KL;Hentze MW;Kohlbacher O;Urlaub H
通讯作者：
Urlaub H