Applying ICC* to DNA translocation: Effect of dielectric boundaries
Applying ICC* to DNA translocation: Effect of dielectric boundaries
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将 ICC* 应用于 DNA 易位：介电边界的影响
DOI：
10.1016/j.cpc.2010.08.014
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发表时间：
2011
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
C. Holm
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
S. Kesselheim;M. Sega;C. Holm
单个DNA分子通过合成纳米孔的易位过程是在ICC的帮助下研究的，ICC是一种快速准确的算法，可以在分子动力学模拟中考虑介电边界力（DBF）。我们表明，水和膜材料之间的介电对比是负责在低盐浓度下的一个非常高的自由能垒。
The translocation process of a single DNA molecule through a synthetic nanopore is investigated with the help of ICC⋆, a fast and accurate algorithm which allows to take into account dielectric boundary forces (DBF) in molecular dynamics simulations. We show that dielectric contrast between water and membrane material is responsible for a remarkably high free energy barrier at low salt concentrations.
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