Developmental barcoding of whole mouse via homing CRISPR.
Developmental barcoding of whole mouse via homing CRISPR.
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DOI：
10.1126/science.aat9804
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发表时间：
2018-08-31
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Church GM
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kalhor R;Kalhor K;Mejia L;Leeper K;Graveline A;Mali P;Church GM
使用核酸酶诱导的突变的体内条形码化是用于记录生物信息（包括发育谱系）的有力方法;然而，其在哺乳动物系统中的应用受到限制。我们在小鼠中用多个归巢引导RNA呈现体内条形码化，所述多个归巢引导RNA各自产生数百个突变等位基因，并且联合收割机组合以获得指数多样性的条形码。受孕时的激活和整个妊娠期间的持续诱变导致发育条形码化的小鼠，其中信息记录在谱系特异性突变中。我们使用这些记录可靠的事后重建最早的谱系和调查轴的发展在大脑中。我们的研究结果为哺乳动物模型系统中的体内条形码化和谱系追踪提供了一个使能和通用的平台。使用多个独立的条形码化基因座在小鼠模型中实施体内条形码化以记录和重建谱系。
In vivo barcoding using nuclease-induced mutations is a powerful approach for recording biological information, including developmental lineages; however, its application in mammalian systems has been limited. We present in vivo barcoding in the mouse with multiple homing guide RNAs that each generate hundreds of mutant alleles and combine for an exponential diversity of barcodes. Activation upon conception and continued mutagenesis through gestation result in developmentally barcoded mice wherein information is recorded in lineage-specific mutations. We use these recordings for reliable post hoc reconstruction of the earliest lineages and investigating axis development in the brain. Our results provide an enabling and versatile platform for in vivo barcoding and lineage tracing in a mammalian model system. In vivo barcoding is implemented in a mouse model using multiple independent barcoding loci to record and reconstruct lineages.
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