Draft genome sequence of the rubber tree Hevea brasiliensis.
Draft genome sequence of the rubber tree Hevea brasiliensis.
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DOI：
10.1186/1471-2164-14-75
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发表时间：
2013-02-02
期刊：
影响因子：
4.4
通讯作者：
Alam M
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Rahman AY;Usharraj AO;Misra BB;Thottathil GP;Jayasekaran K;Feng Y;Hou S;Ong SY;Ng FL;Lee LS;Tan HS;Sakaff MK;Teh BS;Khoo BF;Badai SS;Aziz NA;Yuryev A;Knudsen B;Dionne-Laporte A;Mchunu NP;Yu Q;Langston BJ;Freitas TA;Young AG;Chen R;Wang L;Najimudin N;Saito JA;Alam M
巴西橡胶树（Hevea brasiliensis）是大戟科（Euphorbiaceae）植物，是天然橡胶的主要商业来源。天然橡胶是一种具有高弹性、柔韧性和回弹性的乳胶聚合物，自1876年以来一直在世界经济中发挥着关键作用。在此，我们报告了H.巴西的。组装跨越估计的2.15 Gb单倍体基因组的~1.1 Gb。总体而言，约78%的基因组被鉴定为重复DNA。基因预测显示了68，955个基因模型，其中12.7%是橡胶树特有的。与橡胶生物合成、橡胶木形成、抗病性和致敏性相关的大多数关键基因已经被鉴定。从这一基因组序列中获得的知识将有助于未来高产克隆的发展，以跟上对天然橡胶日益增长的需求。
Hevea brasiliensis, a member of the Euphorbiaceae family, is the major commercial source of natural rubber (NR). NR is a latex polymer with high elasticity, flexibility, and resilience that has played a critical role in the world economy since 1876. Here, we report the draft genome sequence of H. brasiliensis. The assembly spans ~1.1 Gb of the estimated 2.15 Gb haploid genome. Overall, ~78% of the genome was identified as repetitive DNA. Gene prediction shows 68,955 gene models, of which 12.7% are unique to Hevea. Most of the key genes associated with rubber biosynthesis, rubberwood formation, disease resistance, and allergenicity have been identified. The knowledge gained from this genome sequence will aid in the future development of high-yielding clones to keep up with the ever increasing need for natural rubber.
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