The "PepSAVI-MS" Pipeline for Natural Product Bioactive Peptide Discovery.
The "PepSAVI-MS" Pipeline for Natural Product Bioactive Peptide Discovery.
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DOI：
10.1021/acs.analchem.6b03625
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发表时间：
2017-01-17
影响因子：
7.4
通讯作者：
Hicks LM
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kirkpatrick CL;Broberg CA;McCool EN;Lee WJ;Chao A;McConnell EW;Pritchard DA;Hebert M;Fleeman R;Adams J;Jamil A;Madera L;Strömstedt AA;Göransson U;Liu Y;Hoskin DW;Shaw LN;Hicks LM
最近广泛耐药细菌病原体的增加以及相关的发病率和死亡率的增加表明迫切需要具有新的作用机制的新型抗生素骨干。在这里，我们报告了PepSAVI-MS管道的发展，用于发现生物活性肽。这个高度通用的平台采用质谱法和统计学来识别复杂生物样品中的生物活性肽目标。我们通过从植物物种Viola odorata中成功鉴定已知的生物活性肽来验证该平台的使用。利用这条管道，我们已经拓宽了已知的抗菌光谱，包括环堇菜酸O2对鲍曼不动杆菌的抗菌活性。我们进一步证明了该平台的广泛适用性，通过其对卵巢癌、乳腺癌和前列腺癌细胞系的细胞毒性鉴定了环紫罗兰素的新型抗癌活性。
The recent increase in extensively drug resistant bacterial pathogens and the associated increase of morbidity and mortality demonstrate the immediate need for new antibiotic backbones with novel mechanisms of action. Here, we report the development of the PepSAVI-MS pipeline for bioactive peptide discovery. This highly versatile platform employs mass spectrometry and statistics to identify bioactive peptide targets from complex biological samples. We validate the use of this platform through the successful identification of known bioactive peptides from a botanical species, Viola odorata. Using this pipeline, we have widened the known antimicrobial spectrum for V. odorata cyclotides, including antibacterial activity of cycloviolacin O2 against A. baumannii. We further demonstrate the broad applicability of the platform through the identification of novel anticancer activities for cycloviolacins by their cytotoxicity against ovarian, breast and prostate cancer cell lines.
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DOI：
10.1007/s13361-014-1034-5
发表时间：
2015-03
影响因子：
3.2
作者：
Guerrero A;Lerno L;Barile D;Lebrilla CB
通讯作者：
Lebrilla CB
影响因子：
7.3
作者：
Fleeman, Renee;LaVoi, Travis M.;Shaw, Lindsey N.
通讯作者：
Shaw, Lindsey N.
影响因子：
11.8
作者：
Boucher, Helen W.;Talbot, George H.;Bartlett, John
通讯作者：
Bartlett, John
影响因子：
3.1
作者：
Lai, YC;Yang, SL;Chang, HY
通讯作者：
Chang, HY
影响因子：
2
作者：
Langsdorf, Markus;Ghassempour, Alireza;Spengler, Bernhard
通讯作者：
Spengler, Bernhard