The genetic landscape of a cell.
The genetic landscape of a cell.
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DOI：
10.1126/science.1180823
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发表时间：
2010-01-22
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Boone C
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Costanzo M;Baryshnikova A;Bellay J;Kim Y;Spear ED;Sevier CS;Ding H;Koh JL;Toufighi K;Mostafavi S;Prinz J;St Onge RP;VanderSluis B;Makhnevych T;Vizeacoumar FJ;Alizadeh S;Bahr S;Brost RL;Chen Y;Cokol M;Deshpande R;Li Z;Lin ZY;Liang W;Marback M;Paw J;San Luis BJ;Shuteriqi E;Tong AH;van Dyk N;Wallace IM;Whitney JA;Weirauch MT;Zhong G;Zhu H;Houry WA;Brudno M;Ragibizadeh S;Papp B;Pál C;Roth FP;Giaever G;Nislow C;Troyanskaya OG;Bussey H;Bader GD;Gingras AC;Morris QD;Kim PM;Kaiser CA;Myers CL;Andrews BJ;Boone C
通过检查540万个基因-基因对的合成遗传相互作用，构建了基因组规模的遗传相互作用图谱，为芽殖酵母（Saccharomyces cerevisiae）中约75%的所有基因生成了定量遗传相互作用图谱。一个网络的基础上的遗传相互作用的档案揭示了一个功能图的细胞中，类似的生物过程的基因簇在一起，在连贯的子集，和高度相关的配置文件描绘特定的途径来定义基因的功能。全球网络识别所有生物过程之间的功能交叉连接，绘制多效性的细胞布线图。遗传互作程度与许多不同的基因属性相关，这可能是其他生物遗传网络枢纽的信息。我们还表明，广泛和公正的遗传景观映射提供了一个关键的化学-遗传相互作用和药物靶点识别的解释。
A genome-scale genetic interaction map was constructed by examining 5.4 million gene-gene pairs for synthetic genetic interactions, generating quantitative genetic interaction profiles for ~75% of all genes in the budding yeast, Saccharomyces cerevisiae. A network based on genetic interaction profiles reveals a functional map of the cell in which genes of similar biological processes cluster together in coherent subsets, and highly correlated profiles delineate specific pathways to define gene function. The global network identifies functional cross-connections between all bioprocesses, mapping a cellular wiring diagram of pleiotropy. Genetic interaction degree correlated with a number of different gene attributes, which may be informative about genetic network hubs in other organisms. We also demonstrate that extensive and unbiased mapping of the genetic landscape provides a key for interpretation of chemical-genetic interactions and drug target identification.
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DOI：
10.1073/pnas.0712255105
发表时间：
2008-03-04
影响因子：
11.1
作者：
Mani, Ramamurthy;Onge, Robert P. St.;Roth, Frederick P.
通讯作者：
Roth, Frederick P.
影响因子：
56.9
作者：
Kim, Philip M.;Lu, Long J.;Gerstein, Mark B.
通讯作者：
Gerstein, Mark B.
影响因子：
30.8
作者：
St Onge, Robert P.;Mani, Ramamurthy;Giaever, Guri
通讯作者：
Giaever, Guri
影响因子：
64.8
作者：
Gavin, AC;Aloy, P;Superti-Furga, G
通讯作者：
Superti-Furga, G
影响因子：
9.8
作者：
Levy, Sasha F.;Siegal, Mark L.
通讯作者：
Siegal, Mark L.