Association of a functional IRF7 variant with systemic lupus erythematosus.
Association of a functional IRF7 variant with systemic lupus erythematosus.
复制标题
DOI：
10.1002/art.30193
复制
发表时间：
2011-03
影响因子：
--
通讯作者：
Tsao, Betty P.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Fu, Qiong;Zhao, Jian;Qian, XiaoXia;Wong, Jonathan L. H.;Kaufman, Kenneth M.;Yu, C. Yung;Howe, Hwee Siew;Mok, Mo Yin;Harley, John B.;Guthridge, Joel M.;Song, Yeong Wook;Cho, Soo-Kyung;Bae, Sang-Cheol;Grossman, Jennifer M.;Hahn, Bevra H.;Arnett, Frank C.;Shen, Nan;Tsao, Betty P.
此前在欧洲裔人群中开展的全基因组关联研究确定了rs4963128，这是KIAA1542基因的一个单核苷酸多态性（SNP），位于IRF7基因端粒方向23千碱基对处，与系统性红斑狼疮（SLE）存在强关联。本研究旨在探究IRF7基因内的遗传多态性是否为SLE发病的一个风险因素。
我们利用定制的Beadstation Infinium II平台（Illumina公司），对亚洲人群（病例组与对照组：1302例对1479例）中的一个KIAA1542基因SNP（rs4963128）和一个IRF7基因SNP（rs1131665，Q412R）进行基因分型，以评估它们与SLE的关联性。随后，通过Taqman基因分型检测法，对来自中国人群（528例对527例）、欧裔美国人（EA，446例对461例）和非裔美国人（AA，159例对115例）的独立样本中的rs1131665进行进一步基因分型，以在不同种族群体中验证这种关联性。采用荧光素酶报告基因检测法评估Q412R多态性对IRF7激活的影响。
在亚洲、EA和AA人群中均确定了rs1131665（Q412R）与SLE之间存在一致的关联性（病例组与对照组：2435例对2582例；合并P值 = 6.18×10⁻⁶，优势比 = 1.42[1.22 - 1.65]）。与IRF7 412R的表达相比，IRF7 412Q风险等位基因的表达使干扰素刺激反应元件（ISRE）转录活性提高了2倍（P = 0.0003），这表明IRF7 412Q赋予了IRF7更高的活性，因此可能影响下游的干扰素通路。
我们发现，IRF7基因中一个非同义SNP rs1131665的主要等位基因（412Q）赋予了IRF7更高的激活水平，并使多个种族群体易患SLE。这一结果提供了直接的遗传学证据，支持IRF7可能是人类SLE的一个风险基因。
Previous genome wide association study conducted in a population of European ancestry identified rs4963128, a KIAA1542 SNP 23kb telomeric to IRF7, in strong association with SLE. This study was undertaken to investigate whether genetic polymorphism within IRF7 is a risk factor for the development of SLE. We genotyped one KIAA1542 SNP rs4963128 and one IRF7 SNP rs1131665 (Q412R) in an Asian population (cases vs. controls: 1302 vs.1479) to assess their association with SLE using custom-designed Beadstation Infinium II platform (Illumina). Subsequently, rs1131665 was further genotyped in independent panels of Chinese (528 vs.527), European American (EA) (446 vs.461) and African American (AA) (159 vs.115) by Taqman genotyping assay to seek confirmation of association in various ethnic groups. Luciferase reporter assay was used to assess the effect of Q412R polymorphism on the activation of IRF7. Consistent association of rs1131665 (Q412R) with SLE was identified in Asian, EA and AA populations (case vs. control: 2435 vs. 2582; Pmeta = 6.18×10−6, OR = 1.42[1.22–1.65]). Expression of IRF7 412Q risk allele resulted in a 2-fold increase in ISRE transcriptional activity compared with expression of IRF7 412R (P = 0.0003), suggesting IRF7 412Q confers elevated IRF7 activity and may therefore affect downstream IFN pathway. We showed that the major allele of a nonsynonymous SNP rs1131665 (412Q) in IRF7 confers elevated IRF7 activation and predisposes to the development of SLE in multiple ethnic groups. This result provides direct genetic evidence supporting IRF7 may be a risk gene for human SLE.
登录
查看更多内容
影响因子：
--
作者：
Salloum, Rafah;Franek, Beverly S.;Kariuki, Silvia N.;Rhee, Lesley;Mikolaitis, Rachel A.;Jolly, Meenakshi;Utset, Tammy O.;Niewold, Timothy B.
通讯作者：
Niewold, Timothy B.
对全身性红斑狼疮的遗传基础的最新见解。
影响因子：
5
作者：
Moser, K. L.;Kelly, J. A.;Lessard, C. J.;Harley, J. B.
通讯作者：
Harley, J. B.
影响因子：
64.8
作者：
Honda, K;Yanai, H;Taniguchi, T
通讯作者：
Taniguchi, T
影响因子：
30.8
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
--
作者：
Feng, Xuebing;Wu, Hui;Tsao, Betty P.
通讯作者：
Tsao, Betty P.