Sensitive and specific single-molecule sequencing of 5-hydroxymethylcytosine.
Sensitive and specific single-molecule sequencing of 5-hydroxymethylcytosine.
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DOI：
10.1038/nmeth.1779
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发表时间：
2011-11-20
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Korlach, Jonas
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Song, Chun-Xiao;Clark, Tyson A.;Lu, Xing-Yu;Kislyuk, Andrey;Dai, Qing;Turner, Stephen W.;He, Chuan;Korlach, Jonas
将生物正交的选择性5-羟甲基胞嘧啶(5-HMC)化学标记方法与单分子实时(SMRT)DNA测序相结合，实现了对基因组DNA中5-羟甲基胞嘧啶(5-HMC)的单链特异、碱基分辨检测。化学标记不仅可以亲和富含5-HMC的DNA片段，还可以在SMRT测序过程中增强5-HMC的动力学信号。我们应用该方法对基因组DNA样本中的5-HMC进行了高置信度测序。
We describe strand-specific, base-resolution detection of 5-hydroxymethylcytosine (5-hmC) in genomic DNA with single-molecule sensitivity, combining a bioorthogonal, selective chemical labeling method of 5-hmC with single-molecule, real-time (SMRT) DNA sequencing. The chemical labeling not only allows affinity enrichment of 5-hmC–containing DNA fragments but also enhances the kinetic signal of 5-hmC during SMRT sequencing. We applied the approach to sequence 5-hmC in a genomic DNA sample with high confidence.
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影响因子：
48
作者：
Flusberg, Benjamin A.;Webster, Dale R.;Lee, Jessica H.;Travers, Kevin J.;Olivares, Eric C.;Clark, Tyson A.;Korlach, Jonas;Turner, Stephen W.
通讯作者：
Turner, Stephen W.
影响因子：
64.5
作者：
Bhutani N;Burns DM;Blau HM
通讯作者：
Blau HM
影响因子：
16
作者：
Xu Y;Wu F;Tan L;Kong L;Xiong L;Deng J;Barbera AJ;Zheng L;Zhang H;Huang S;Min J;Nicholson T;Chen T;Xu G;Shi Y;Zhang K;Shi YG
通讯作者：
Shi YG
DOI：
10.1126/science.1170116
发表时间：
2009-05-15
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Tahiliani M;Koh KP;Shen Y;Pastor WA;Bandukwala H;Brudno Y;Agarwal S;Iyer LM;Liu DR;Aravind L;Rao A
通讯作者：
Rao A
影响因子：
10.5
作者：
Wu, Hao;D'Alessio, Ana C.;Zhang, Yi
通讯作者：
Zhang, Yi