Diterpene cyclases and the nature of the isoprene fold.
Diterpene cyclases and the nature of the isoprene fold.
复制标题
DOI：
10.1002/prot.22751
复制
发表时间：
2010-08-15
影响因子：
2.9
通讯作者：
Odfield, Eric
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Cao, Rong;Zhang, Yonghui;Mann, Francis M.;Huang, Cancan;Mukkamala, Dushyant;Hudock, Michael P.;Mead, Matthew E.;Prisic, Sladjana;Wang, Ke;Lin, Fu-Yang;Chang, Ting-Kai;Peters, Reuben J.;Odfield, Eric
许多萜烯环化酶的结构和作用机制是已知的，但没有二萜环化酶的结构。在这里，我们提出了基于生物信息学，定点诱变，结构域交换，酶抑制和光谱学的结构模型，有助于解释二萜环化酶的结构，功能和进化的性质。细菌二萜环化酶含有120个α-螺旋和与三萜环化酶相同的保守的“QW”和DxDD基序，表明存在βγ桶结构。植物二萜环化酶具有类似的催化基序和βγ结构域，与第三个结构域α结构域一起形成αβγ结构，在H+启动的环化酶中，γ结构域中存在EDxxD样Mg 2 +/二磷酸结合基序。这些结果支持了萜环化酶结构和功能的新观点，并提示了从古老的（βγ）细菌三萜环化酶到（βγ）细菌再到（αβγ）植物二萜环化酶的进化。
The structures and mechanism of action of many terpene cyclases are known, but there are no structures of diterpene cyclases. Here, we propose structural models based on bioinformatics, site-directed mutagenesis, domain swapping, enzyme inhibition and spectroscopy that help explain the nature of diterpene cyclase structure, function, and evolution. Bacterial diterpene cyclases contain ∼20 α-helices and the same conserved “QW” and DxDD motifs as in triterpene cyclases, indicating the presence of a βγ barrel structure. Plant diterpene cyclases have a similar catalytic motif and βγ-domain structure together with a third, α-domain, forming an αβγ structure, and in H+-initiated cyclases, there is an EDxxD-like Mg2+/diphosphate binding motif located in the γ-domain. The results support a new view of terpene cyclase structure and function and suggest evolution from ancient (βγ) bacterial triterpene cyclases to (βγ) bacterial and thence to (αβγ) plant diterpene cyclases.
登录
查看更多内容
影响因子：
3.5
作者：
Hayashi, Ken-ichiro;Kawaide, Hiroshi;Nozaki, Hiroshi
通讯作者：
Nozaki, Hiroshi
影响因子：
4.3
作者：
Anterola, Aldwin;Shanle, Erin;Renzaglia, Karen
通讯作者：
Renzaglia, Karen
影响因子：
5.8
作者：
Cuff, JA;Clamp, ME;Barton, GJ
通讯作者：
Barton, GJ
影响因子：
2.9
作者：
Abe, I;Zheng, YF;Prestwich, GD
通讯作者：
Prestwich, GD
DOI：
10.1111/j.1432-1033.1996.0051r.x
发表时间：
1996-11-01
期刊：
EUROPEAN JOURNAL OF BIOCHEMISTRY
影响因子：
--
作者：
Feil, C;Sussmuth, R;Poralla, K
通讯作者：
Poralla, K