The interferon stimulated gene-encoded protein HELZ2 inhibits human LINE-1 retrotransposition and LINE-1 RNA-mediated type I interferon induction.
The interferon stimulated gene-encoded protein HELZ2 inhibits human LINE-1 retrotransposition and LINE-1 RNA-mediated type I interferon induction.
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DOI：
10.1038/s41467-022-35757-6
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发表时间：
2023-01-13
影响因子：
16.6
通讯作者：
Miyoshi, Tomoichiro
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Luqman-Fatah, Ahmad;Watanabe, Yuzo;Uno, Kazuko;Ishikawa, Fuyuki;Moran, John V.;Miyoshi, Tomoichiro
一些干扰素刺激基因（ISG）编码抑制LINE-1（L1）逆转录转座的蛋白质。在这里，我们使用免疫沉淀，然后液相色谱-串联质谱法，以确定与核糖核蛋白颗粒中的L1 ORF 1编码蛋白（ORF 1 p）相关的蛋白质。三种与ORF 1 p相互作用的ISG蛋白抑制反转录转座：HECT和RLD结构域包含E3泛素蛋白连接酶5（HERC 5）; 2′−5′-寡腺苷酸合成酶样（OASL）;和锌指解旋酶2（HELZ 2）。HERC 5使ORF 1 p不稳定，但不影响其细胞定位。OASL损害ORF 1 p胞质灶形成。HELZ 2识别L1 5′UTR内的序列和/或结构，以降低L1 RNA、ORF 1 p和ORF 1 p胞质病灶水平。WT或逆转录酶缺陷型L1的过表达导致IFN-α表达的适度诱导，其在HELZ 2过表达时被废除。值得注意的是，IFN-α表达在ORF 1 p RNA结合突变体过表达时增强，表明ORF 1 p结合可能保护L1 RNA免受“触发”IFN-α诱导。因此，ISG蛋白可以通过不同的机制抑制反转录转座。蛋白质组学分析显示，一组干扰素刺激的基因抑制LINE-1逆转录转座子活性，包括HELZ 2，其降低LINE-1 RNA和相关的先天免疫应答水平。
Some interferon stimulated genes (ISGs) encode proteins that inhibit LINE-1 (L1) retrotransposition. Here, we use immunoprecipitation followed by liquid chromatography-tandem mass spectrometry to identify proteins that associate with the L1 ORF1-encoded protein (ORF1p) in ribonucleoprotein particles. Three ISG proteins that interact with ORF1p inhibit retrotransposition: HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin-protein ligase 5 (HERC5); 2′−5′-oligoadenylate synthetase-like (OASL); and helicase with zinc finger 2 (HELZ2). HERC5 destabilizes ORF1p, but does not affect its cellular localization. OASL impairs ORF1p cytoplasmic foci formation. HELZ2 recognizes sequences and/or structures within the L1 5′UTR to reduce L1 RNA, ORF1p, and ORF1p cytoplasmic foci levels. Overexpression of WT or reverse transcriptase-deficient L1s lead to a modest induction of IFN-α expression, which is abrogated upon HELZ2 overexpression. Notably, IFN-α expression is enhanced upon overexpression of an ORF1p RNA binding mutant, suggesting ORF1p binding might protect L1 RNA from “triggering” IFN-α induction. Thus, ISG proteins can inhibit retrotransposition by different mechanisms. Proteomic analyses revealed that a group of interferon-stimulated genes suppresses LINE-1 retrotransposon activities, including HELZ2, which reduces LINE-1 RNA and the associated innate immune response levels.
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DOI：
10.1146/annurev-genom-082509-141802
发表时间：
2011
影响因子：
8.7
作者：
Beck CR;Garcia-Perez JL;Badge RM;Moran JV
通讯作者：
Moran JV
内源性移动元素在人群量表上对人类基因组的诱变。
影响因子：
7
作者：
Chuang NT;Gardner EJ;Terry DM;Crabtree J;Mahurkar AA;Rivell GL;Hong CC;Perry JA;Devine SE
通讯作者：
Devine SE
影响因子：
3.3
作者：
Arjan-Odedra S;Swanson CM;Sherer NM;Wolinsky SM;Malim MH
通讯作者：
Malim MH
DOI：
10.1073/pnas.0831042100
发表时间：
2003-04-29
影响因子：
11.1
作者：
Brouha, B;Schustak, J;Kazazian, HH
通讯作者：
Kazazian, HH
影响因子：
3.2
作者：
Awano, Naoki;Rajagopal, Vaishnavi;Phadtare, Sangita
通讯作者：
Phadtare, Sangita