Structure and dynamics of a processive Brownian motor: the translating ribosome.
Structure and dynamics of a processive Brownian motor: the translating ribosome.
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DOI：
10.1146/annurev-biochem-060408-173330
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发表时间：
2010
影响因子：
16.6
通讯作者：
Gonzalez RL Jr
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Frank J;Gonzalez RL Jr
越来越多的证据表明，蛋白质合成的驱动和调节机制，直接随机，大规模的构象波动的翻译装置。这一机制的范例意味着，自由能景观管理的构象状态，可访问和采样的翻译核糖体。这种情况下，蛋白质合成的结构和动态研究提出了相互依存的机会和挑战。事实上，低温电子显微镜和X-射线晶体学结构的研究，一方面，和单分子荧光共振能量转移（smFRET）动态研究，另一方面，之间的协同作用，正在成为一个强大的手段，调查复杂的自由能景观的翻译核糖体和揭示的机制，直接随机构象波动的翻译机器。在这篇综述中，我们强调了从低温电子显微镜，X射线晶体学和smFRET研究蛋白质合成的延伸阶段获得的主要见解，并概述了新出现的主题，问题和挑战，摆在前面的机械翻译研究。
There is mounting evidence indicating that protein synthesis is driven and regulated by mechanisms that direct stochastic, large-scale conformational fluctuations of the translational apparatus. This mechanistic paradigm implies that a free-energy landscape governs the conformational states that are accessible to and sampled by the translating ribosome. This scenario presents interdependent opportunities and challenges for structural and dynamic studies of protein synthesis. Indeed, the synergism between cryogenic electron microscopic and X-ray crystallographic structural studies, on the one hand, and single-molecule fluorescence resonance energy transfer (smFRET) dynamic studies, on the other, is emerging as a powerful means for investigating the complex free-energy landscape of the translating ribosome and uncovering the mechanisms that direct the stochastic conformational fluctuations of the translational machinery. In this review, we highlight the principal insights obtained from cryogenic electron microscopic, X-ray crystallographic, and smFRET studies of the elongation stage of protein synthesis and outline the emerging themes, questions, and challenges that lie ahead in mechanistic studies of translation.
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影响因子：
2.9
作者：
Andrec, M;Levy, RM;Talaga, DS
通讯作者：
Talaga, DS
DOI：
10.1038/10695
发表时间：
1999-07-01
期刊：
NATURE STRUCTURAL BIOLOGY
影响因子：
--
作者：
Agrawal, RK;Heagle, AB;Frank, J
通讯作者：
Frank, J
DOI：
10.1073/pnas.0607541103
发表时间：
2006-10-24
影响因子：
11.1
作者：
Berk, Veysel;Zhang, Wen;Cate, Jamie H. Doudna
通讯作者：
Cate, Jamie H. Doudna
影响因子：
56.9
作者：
Boehr, David D.;McElheny, Dan;Wright, Peter E.
通讯作者：
Wright, Peter E.
影响因子：
56.9
作者：
Carter, AP;Clemons, WM;Ramakrishnan, V
通讯作者：
Ramakrishnan, V