Microarray retriever: a web-based tool for searching and large scale retrieval of public microarray data.
Microarray retriever: a web-based tool for searching and large scale retrieval of public microarray data.
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DOI：
10.1093/nar/gkn213
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发表时间：
2008-07-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Brandt, Bernd W.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Ivliev, Alexander E.;'t Hoen, Peter A. C.;Villerius, Michel P.;den Dunnen, Johan T.;Brandt, Bernd W.
主要的公共微阵列存储库Gene Expression Omnibus和ArrayExpress正在迅速发展。这使得荟萃分析研究成为可能，在荟萃分析研究中，来自多个单独研究的表达数据被结合起来。为了促进这些类型的研究，我们开发了微阵列检索器，用于搜索和检索GEO和ArrayExpress的数据。该工具允许同时访问两个存储库，使用复杂的查询在存储库中进行搜索，检索已发表文章的微阵列数据，并在一个结构化存档中下载数据。该工具可在web上获得：http://www.lgtc.nl/MaRe/
The major public microarray repositories Gene Expression Omnibus and ArrayExpress are growing rapidly. This enables meta-analysis studies, in which expression data from multiple individual studies are combined. To facilitate these types of studies, we developed Microarray Retriever for searching and retrieval of data from GEO and ArrayExpress. The tool allows access to the two repositories simultaneously, to search in the repositories using complex queries, to retrieve microarray data for published articles and to download data in one structured archive. The tool is available on the web at: http://www.lgtc.nl/MaRe/
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