Recurrent mutations in epigenetic regulators, RHOA and FYN kinase in peripheral T cell lymphomas.
Recurrent mutations in epigenetic regulators, RHOA and FYN kinase in peripheral T cell lymphomas.
复制标题
DOI：
10.1038/ng.2873
复制
发表时间：
2014-02
期刊：
影响因子：
30.8
通讯作者：
Ferrando, Adolfo A.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Palomero, Teresa;Couronne, Lucile;Khiabanian, Hossein;Kim, Mi-Yeon;Ambesi-Impiombato, Alberto;Perez-Garcia, Arianne;Carpenter, Zachary;Abate, Francesco;Allegretta, Maddalena;Haydu, J. Erika;Jiang, Xiaoyu;Lossos, Izidore S.;Nicolas, Concha;Balbin, Milagros;Bastard, Christian;Bhagat, Govind;Piris, Miguel A.;Campo, Elias;Bernard, Olivier A.;Rabadan, Raul;Ferrando, Adolfo A.
外周T细胞淋巴瘤(PTCL)是一组异质性的非霍奇金淋巴瘤，人们对其知之甚少。在这里，我们结合了12对肿瘤-正常DNA的完整外显子组测序，RNAseq分析和靶向深度测序，以确定PTCL转化中的新的遗传变化。这些分析发现TET2、DNMT3A和IDH2中存在高度复发的表观遗传因子突变，在22/35(67%)的血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤(AITL)和8/44(18%)的PTCL(PTCL)样本中存在新的高度流行的RHOA p.Gly17Val(NM_001664)突变。从机制上讲，RHOA Gly17Val蛋白在生化和细胞分析中干扰RHOA信号传递，这一效应可能是通过隔离激活的鸟嘌呤交换因子(Genf)蛋白介导的。此外，我们描述了新的和反复发生的，尽管不太常见的遗传缺陷，包括FYN，ATM，B2M和CD58突变，涉及SRC信号，DNA损伤反应受损，以及在PTCL发病过程中逃避免疫监视机制。
Peripheral T-cell lymphomas (PTCLs) are a heterogeneous and poorly understood group of non Hodgkin lymphomas. Here we combined whole exome sequencing of 12 tumor-normal DNA pairs, RNAseq analysis and targeted deep sequencing to identify new genetic alterations in PTCL transformation. These analyses identified highly recurrent epigenetic factor mutations in TET2, DNMT3A and IDH2 as well as a new highly prevalent RHOA p.Gly17Val (NM_001664) mutation present in 22/35 (67%) of angioimmunoblastic T-cell lymphomas (AITL) and in 8/44 (18%) not otherwise specified PTCL (PTCL NOS) samples. Mechanistically, the RHOA Gly17Val protein interferes with RHOA signaling in biochemical and cellular assays, an effect potentially mediated by the sequestration of activated Guanine Exchange Factor (GEF) proteins. In addition, we describe new and recurrent, albeit less frequent, genetic defects including mutations in FYN, ATM, B2M and CD58 implicating SRC signaling, impaired DNA damage response and escape from immune surveillance mechanisms in the pathogenesis of PTCL.
登录
查看更多内容
影响因子：
48
作者：
Langmead, Ben;Salzberg, Steven L.
通讯作者：
Salzberg, Steven L.
影响因子：
14.8
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
3
作者：
Pettersen, EF;Goddard, TD;Ferrin, TE
通讯作者：
Ferrin, TE
影响因子：
12.8
作者：
Armitage, James O.
通讯作者：
Armitage, James O.
DOI：
10.1093/bioinformatics/btp698
发表时间：
2010-03-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Li H;Durbin R
通讯作者：
Durbin R